1990年2月27日，中國(guó)吸煙與健康協(xié)會(huì)正式成立。吳階平副委員長(zhǎng)任首屆協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng)，衛(wèi)生部副部長(zhǎng)曹榮桂兼任第二屆協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng)。協(xié)會(huì)成立以后，在組織建設(shè)、學(xué)術(shù)研究、控?zé)熃】到逃顒?dòng)和對(duì)外交流等多個(gè)領(lǐng)域中取得重大進(jìn)展。協(xié)會(huì)下設(shè)辦公室、組織宣傳部、學(xué)術(shù)聯(lián)絡(luò)部、青少年控?zé)煿ぷ鞑?；成立了中?guó)控?zé)煴＝∑穼I(yè)委員會(huì)和青少年控?zé)煂I(yè)委員會(huì)，出版《中國(guó)吸煙與健康通訊》。

1990年－2000年，全國(guó)有31個(gè)省、自治區(qū)、直轄市、計(jì)劃單列市先后建立了吸煙與健康協(xié)會(huì)，許多市（縣、區(qū)）也建立了相應(yīng)的組織。

2000年12月，中國(guó)吸煙與健康協(xié)會(huì)主辦的《中國(guó)吸煙與健康通訊》10年來共印發(fā)40期，為國(guó)內(nèi)外互通信息、交流控?zé)煿ぷ鹘?jīng)驗(yàn)、指導(dǎo)各地開展控?zé)熃】到逃ぷ?，發(fā)揮了積極作用。此外，該協(xié)會(huì)還編印了《保持不吸煙者免受煙害》《吸煙有害健康》《世界各國(guó)控?zé)熈⒎ā泛汀吨袊?guó)控制吸煙有關(guān)法規(guī)匯編》等宣傳教育資料。

為進(jìn)一步加強(qiáng)我國(guó)的煙草危害控制工作，遏制煙草流行所造成的健康和經(jīng)濟(jì)損害，保障人民群眾身體健康，促進(jìn)國(guó)民經(jīng)濟(jì)和社會(huì)發(fā)展，衛(wèi)生部于2002年成立國(guó)家控?zé)熮k公室（National　Tobacco　Control　Office），掛靠在中國(guó)CDC慢性非傳染性疾病預(yù)防控制中心。它是衛(wèi)生部領(lǐng)導(dǎo)下的國(guó)家級(jí)煙草危害控制專業(yè)機(jī)構(gòu)，是煙草危害控制的全國(guó)業(yè)務(wù)技術(shù)指導(dǎo)中心。

2002年11月28日，中國(guó)吸煙與健康協(xié)會(huì)青少年控?zé)煂I(yè)委員會(huì)、醫(yī)院控?zé)煂I(yè)委員會(huì)，經(jīng)民政部批準(zhǔn)正式成立。

2003年8月18日，中國(guó)吸煙與健康協(xié)會(huì)媒體與演藝界專業(yè)委員會(huì)，經(jīng)民政部批準(zhǔn)登記成立。

為了積極有效地履行《煙草控制框架公約》，2007年4月，國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)成立由發(fā)改委、衛(wèi)生部、外交部、財(cái)政部、海關(guān)總署、工商總局、質(zhì)檢總局和煙草局等8個(gè)部門組成《煙草控制框架公約》履約工作部際協(xié)調(diào)領(lǐng)導(dǎo)小組，負(fù)責(zé)協(xié)調(diào)全國(guó)的控?zé)熉募s工作。