一是全省產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新能力較弱，缺乏成長性好、產(chǎn)業(yè)鏈長、帶動性強的新興產(chǎn)業(yè)及重點優(yōu)勢產(chǎn)業(yè)，骨干產(chǎn)業(yè)產(chǎn)品處于產(chǎn)業(yè)鏈和價值鏈低端，缺乏競爭力和高附加值的產(chǎn)品，有效供給不足。2015年1～11月，全省六大戰(zhàn)略性新興工業(yè)產(chǎn)業(yè)累計實現(xiàn)增加值319.33億元，同比增長5.3%，低于規(guī)模以上工業(yè)增速0.9個百分點，其中，節(jié)能環(huán)保產(chǎn)業(yè)增長0.6%，生物產(chǎn)業(yè)增長4.8%、新材料產(chǎn)業(yè)增長3.0%。六大戰(zhàn)略性新興產(chǎn)業(yè)占全部規(guī)模以上工業(yè)增加值的比重僅為9.6%。

二是全省產(chǎn)業(yè)服務 “四化”水平不高，產(chǎn)業(yè)配套不足，生產(chǎn)性服務業(yè)發(fā)展滯后。全省產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)失衡等深層次矛盾和問題日益凸顯，長期依賴拼資源、拼規(guī)模的發(fā)展模式使云南比其他省區(qū)市在轉(zhuǎn)型發(fā)展上面臨的困難更多，難度更大。

三是云南產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)單一，“一煙獨大”的產(chǎn)業(yè)格局還將持續(xù)一段時間。2015年，僅煙草制品業(yè)就拉動全省規(guī)模以上工業(yè)增加值增長1.6個百分點，增加值增幅貢獻率高達23.5%，增幅貢獻率較上年提升3個百分點，實現(xiàn)利潤總額占全部規(guī)模以上工業(yè)利潤總額的比重達55.0%，而規(guī)模以上非煙工業(yè)實現(xiàn)利潤總額占全部利潤總額的比重僅為45.0%，且非煙工業(yè)利潤總額同比大幅下降，降幅高達28.4%，降幅高于全省規(guī)模以上工業(yè)行業(yè)18.9個百分點，高于煙草行業(yè)43.9個百分點。全省非煙工業(yè)占比低，效益差，阻礙全省產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)優(yōu)化升級，不利于云南整體經(jīng)濟提質(zhì)增效。

四是產(chǎn)業(yè)聚集發(fā)展程度依然較低。云南除煙草、電力、化工、有色、鋼鐵5大行業(yè)集中度較高外，其他行業(yè)大企業(yè) （集團）少，產(chǎn)業(yè)集中度低、競爭力不強，大企業(yè)、大集團培育不足，目前全省只有9家企業(yè)進入全國500強；輕工領(lǐng)域除兩大煙草集團外，沒有一家進入全國500強。全國民營企業(yè)500強中，云南只有5家企業(yè)進入。同時，云南產(chǎn)業(yè)發(fā)展聚集程度不夠，突出表現(xiàn)在高端產(chǎn)業(yè)園區(qū)數(shù)量少，園區(qū)多以初級加工企業(yè)為主，產(chǎn)業(yè)鏈上下游延伸體系尚未建立；缺乏國家級產(chǎn)業(yè)園區(qū)，區(qū)內(nèi)項目不多，處于 “散、小、弱”狀態(tài)，導致云南引進大項目、培育大產(chǎn)業(yè)的載體缺失，園區(qū)發(fā)展同質(zhì)化現(xiàn)象突出，配套協(xié)作化程度低，同質(zhì)性競爭激烈，制約了園區(qū)的健康快速發(fā)展，難于有效形成產(chǎn)業(yè)聚集與集群發(fā)展。現(xiàn)階段，云南產(chǎn)業(yè)聚集發(fā)展程度依然較低，產(chǎn)業(yè)聚集規(guī)模與產(chǎn)出效益與周邊的重慶、貴州、廣西等省區(qū)市相比仍存在不小差距，一定程度上影響了云南經(jīng)濟發(fā)展的速度。