與遺傳表達(dá)
(一)RNA結(jié)構(gòu)與功能
RNA是由DNA攜帶的遺傳信息表達(dá)為生物遺傳表型特性的主要中間環(huán)節(jié)。RNA的基本結(jié)構(gòu)與DNA相類似,但其所含的是核糖核酸而不是脫氧核糖核酸,堿基為A、C、G、U,沒有胸腺嘧啶(T),而含有尿嘧啶。RNA由單鏈構(gòu)成,較DNA短。
根據(jù)RNA在生物性狀遺傳表達(dá)過程中的功能,可分為核糖體RNA(即rRNA)、信使RNA(即mRNA)和轉(zhuǎn)移RNA(即tRNA)3種。
1.rRNA(ribosomalRNA)
這是組成核糖體的主要成分,可占細(xì)胞RNA總量的80%以上或核糖體的65%左右。核糖體是細(xì)胞合成蛋白質(zhì)的場所。原核微生物和真核微生物細(xì)胞內(nèi)的核糖體大小不一樣,其組成也有差異。原核微生物中的核糖體為70S,由分別為50S和30S的2個亞單位組成。30S亞單位(0.9×106Da)由21種蛋白和由1542個核苷酸長的16SrRNA組成;50S亞單位(1.6× 106Da)由32種蛋白與由2904個核苷酸構(gòu)成的23SrRNA和由120個核苷酸構(gòu)成的5SrRNA組成。真核微生物細(xì)胞中的核糖體為80S。細(xì)胞器中的核糖體大小與原核微生物中一樣,是70S的。80S的核糖體由分別為60S和40S的2個亞單位構(gòu)成。60S亞單位(3.2×106Da)由分別為28S(1.6×106Da,4700個核苷酸)、5.8S(0.05×106Da,160個核苷酸)、5S(0.03× 106Da,120核苷酸)的rRNA和40±5種核糖體蛋白質(zhì)組成。40S亞單位(1.6×106Da)由18S (0.9×106Da,1900個核苷酸)和30±5種核糖體蛋白質(zhì)組成。
2.mRNA(messengerRNA)
mRNA的堿基是A、U、C、G,其功能是將DNA上遺傳信息攜帶到合成蛋白質(zhì)的場所核糖體上,即其鏈上堿基的排列順序決定了其所攜帶的遺傳信息。mRNA鏈上每3個核苷酸組成一個三聯(lián)體密碼子(codon),編碼一種氨基酸。所有編碼構(gòu)成蛋白質(zhì)的20種氨基酸的全部密碼子稱為遺傳密碼(genetic code)。按43排列組合全套遺傳密碼,可有64個密碼子,因此,20個氨基酸中除少數(shù)氨基酸如色氨酸、甲硫氨酸外,一個氨基酸可有多個密碼子,如絲氨酸可有UCU、UCA、UCC和UCG4個密碼子編碼。64個密碼子中有3個密碼子(UAA、UGA和UAG)是終止密碼子(stop codon),作為終止合成的信號。mRNA在原核微生物細(xì)胞中的壽命僅幾分鐘,但在真核生物細(xì)胞中可有幾小時乃至幾天。
3.tRNA(transferRNA)
圖6-6 成熟tRNA的結(jié)構(gòu)
Ps—假尿嘧啶,Tu—硫尿嘧啶,Py—嘧啶, Pu—嘌呤,CCA末端為氨基酸結(jié)合部位
tRNA在蛋白質(zhì)合成過程中起將氨基酸運(yùn)輸轉(zhuǎn)移到核糖體上的作用。tRNA鏈通過互補(bǔ)堿基之間的氫鍵折疊成三葉草形特異結(jié)構(gòu),那些非互補(bǔ)的堿基片段形成3個小環(huán)狀(見圖6-6),其中相對于葉柄的小環(huán)為一個反密碼子環(huán)(antico-donloop),上有一個反密碼子(anticodon),用于識別mRNA上的氨基酸密碼子。另外在t R-NA的3′-OH端都有核苷酸CCA序列,是氨基酸結(jié)合部位。
(二)“DNA→RNA→蛋白質(zhì)”的遺傳信息流
DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的奠基人之一F.Crick于1958年首次提出了“DNA→RNA→蛋白質(zhì)(或多肽鏈)”這一遺傳信息單向傳遞的中心法則。在這個中心法則中,從DNA基因到蛋白質(zhì)有兩個過程,前一過程為DNA→RNA,稱為轉(zhuǎn)錄(transcription),后一過程為RNA→蛋白質(zhì),稱為翻譯(translation)。生物中的遺傳信息流見圖6-7。
圖6-7 “DNA→RNA→蛋白質(zhì)”的遺傳信息流
1.轉(zhuǎn)錄過程
轉(zhuǎn)錄(transcription)是將DNA鏈攜帶的遺傳信息(基因)按堿基配對原則轉(zhuǎn)錄于mRNA上,使mRNA鏈上攜帶有DNA鏈攜帶的遺傳基因信息。轉(zhuǎn)錄的一般過程為:由RNA多聚酶和σ因子結(jié)合的全酶與啟動子(promoter)相結(jié)合,σ因子識別DNA鏈上的特定堿基(T或C)序列作為轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn),然后啟動RNA的合成。σ因子在轉(zhuǎn)錄開始后即脫離RNA多聚酶,與另一個RNA多聚酶結(jié)合成全酶進(jìn)入下一輪,使模板的轉(zhuǎn)錄繼續(xù)進(jìn)行。轉(zhuǎn)錄形成的核苷酸鏈按5′→ 3′連接延長,當(dāng)轉(zhuǎn)錄到DNA鏈上終止子堿基序列時即終止轉(zhuǎn)錄,形成了以DNA為模板的一條或多條mRNA鏈。轉(zhuǎn)錄時DNA鏈上可以是一個基因也可以是多個基因構(gòu)成的開放閱讀框(open reading frame,ORF)被轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的RNA分子經(jīng)特定的核酸酶加工成為結(jié)構(gòu)復(fù)雜的rRNA和tRNA分子,而mRNA則直接進(jìn)入翻譯過程,見圖6-8。
圖6-8 DNA上的遺傳信息轉(zhuǎn)錄為mRNA分子示意圖
在真核微生物中轉(zhuǎn)錄后的初生轉(zhuǎn)錄物必須經(jīng)較為復(fù)雜的加工過程即切除內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄單位(introntranscript)將外顯子轉(zhuǎn)錄單位(exon transcript)相互連接才能成為成熟的mRNA。
2.翻譯過程
翻譯過程(translation)即是按照mRNA上的遺傳密碼將氨基酸合成多肽鏈、蛋白質(zhì)的過程,可分為翻譯起始、肽鏈延長和翻譯終止3個階段。第一步是tRNA的3′-OH末端與氨基酸共軛結(jié)合,由氨酰-tRNA合成酶催化形成氨酰-tRNA。處于mRNA5′磷酸末端的一個氨基酸密碼子(一般為AUG,也稱起始密碼子)既可“指示”翻譯開始,又是甲酰甲硫氨酸(formyl methionine,f Met)的密碼子。30S亞單位核糖體結(jié)合于mRNA的起始密碼子AUG上,與f Met-tRNA形成復(fù)合物,這個復(fù)合物隨后結(jié)合到核糖體肽P位點(diǎn)上,第一個氨基酸甲酰甲硫氨基酸到位后,第二個氨基酸通過肽酰轉(zhuǎn)移酶(peptidyl transferase)的作用,與甲酰甲硫氨基酸形成共軛鍵,同時f Met與tRNA之間的鍵斷裂而釋放tRNA,tRNA可再攜帶第二個氨基酸進(jìn)入下一輪循環(huán)。如此反復(fù),使肽鏈不斷延長。當(dāng)核糖體碰到mRNA上不編碼任何氨基酸的終止密碼子如UAA、UAG和UGA時,終止密碼子可占據(jù)50S亞單位核糖體上的A位點(diǎn),一旦A位點(diǎn)被終止密碼子占據(jù),即可被釋放因子所識別,并活化肽酰轉(zhuǎn)移酶,將肽鏈從末端tRNA上釋放下來。核糖體的兩個亞單位再次分開,進(jìn)入新一輪翻譯。在同一mRNA鏈上可同時有一個或多個翻譯過程進(jìn)行,也即同時有一條或多條肽鏈在同時合成。形成的肽鏈必須在協(xié)助因子(chaperone)蛋白的作用下形成大分子蛋白。
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