生命的酶學(xué)說(shuō)
第九章 生命的酶學(xué)說(shuō)
當(dāng)比德?tīng)柋蝗蚊鼮樗固垢4髮W(xué)的生物系教授時(shí),他終于能邀請(qǐng)一位生物化學(xué)家來(lái)從事判別V+物質(zhì)的工作了。他挑選塔特姆是最恰當(dāng)不過(guò)的。塔特姆在威斯康星時(shí),就已在微生物生長(zhǎng)因子這一新興而又令人振奮的研究領(lǐng)域中工作。塔特姆在一年的歐洲生活里結(jié)識(shí)了F.科格,當(dāng)時(shí)科格剛發(fā)現(xiàn)生物素。在歐洲期間,他還認(rèn)識(shí)了尼爾·弗賴(lài)斯——瑞典杰出的真菌學(xué)家,多年來(lái)一直用于鏈孢菌研究的“弗賴(lài)斯培養(yǎng)基”的發(fā)明人。
鏈孢菌研究
上一章講的果蠅研究促使比德?tīng)柈a(chǎn)生了這樣的概念,即野生型產(chǎn)物的合成是由基因控制的一系列反應(yīng)的結(jié)果。對(duì)果蠅的研究還使比德?tīng)柼岢鲞@樣的設(shè)想:對(duì)于每一個(gè)這樣的反應(yīng)都有一個(gè)控制基因。他回顧以往時(shí)說(shuō)道:“因此,看來(lái)有理由假設(shè):一種酶的全部特異性,也許來(lái)源于單個(gè)基因?!保?958,597)正是這種信念使比德?tīng)柡退啬反_信他們能把分析倒過(guò)來(lái)做,即選出已知的代謝需求來(lái)探索它們的遺傳決定。正如孟德?tīng)柕某晒σ蕾?lài)于他深思熟慮地選擇生物體以適合所要解決的特定問(wèn)題(奧爾貝,1966,115),比德?tīng)柡退啬返某晒σ彩侨绱?。他們認(rèn)為,所有的高等動(dòng)植物都應(yīng)排除在外,因?yàn)樗鼈儗?duì)營(yíng)養(yǎng)的要求不是“完全處于研究者的控制之下”;綠藻也不行,因?yàn)樗婕暗姆敝臣夹g(shù)太復(fù)雜;至于細(xì)菌和藍(lán)綠藻,由于它們沒(méi)有有性生殖,而原生動(dòng)物又只是部分地知道它們對(duì)營(yíng)養(yǎng)的要求,所以都不能選用。
另一方面,真菌看來(lái)更有希望。子囊菌類(lèi)的鏈孢菌有生活周期,最合適于作遺傳學(xué)研究,它可以在無(wú)菌條件下生長(zhǎng),對(duì)空間的要求也不很?chē)?yán)格,而且從遺傳學(xué)觀點(diǎn)來(lái)看,對(duì)鏈孢菌已作過(guò)相當(dāng)廣泛的研究。
(比德?tīng)枺?945,644)
比德?tīng)栐诮邮苤Z貝爾獎(jiǎng)的演說(shuō)中,講到他是如何想到鏈孢菌的:
作為康奈爾大學(xué)的研究生,我曾聽(tīng)過(guò)紐約植物園B.O.道奇博士關(guān)于面包霉菌(鏈孢菌)遺傳的學(xué)術(shù)報(bào)告。所謂接合型和白化的第二次分裂分離,使他困惑不解。我們中間的幾個(gè)人剛考察了果蠅四線交換的證據(jù),便提出著絲粒與分離基因之間的交換可以很好地解釋上述結(jié)果。
道奇積極支持把鏈孢菌作為遺傳研究的生物體。他對(duì)摩爾根堅(jiān)持說(shuō):“鏈孢菌甚至比果蠅還好?!钡榔媸悄柛鶎?shí)驗(yàn)室的常客。他最后說(shuō)服摩爾根在從哥倫比亞大學(xué)到加州理工學(xué)院生物學(xué)部工作時(shí),帶走了所收集的鏈孢菌培養(yǎng)物;該生物學(xué)部是摩爾根在1928年創(chuàng)建的。
不久之后,C.C.林德格雷到摩爾根實(shí)驗(yàn)室當(dāng)研究生。人們建議他應(yīng)把研究鏈孢菌遺傳學(xué)作為學(xué)位論文的基礎(chǔ)。選用鏈孢菌真是太幸運(yùn)了,因?yàn)樗哂胸S富的想象力、異常的熱情和充沛的精力,還有E.G.安德森、C.B.布里奇斯、S.埃默森、A.H.斯蒂特文特和研究所其他人員提供意見(jiàn);當(dāng)時(shí)他們對(duì)于交換是減數(shù)分裂機(jī)制一部分的一些問(wèn)題很感興趣。在這樣得天獨(dú)厚的環(huán)境下,林德格雷很快掌握了鏈孢菌遺傳學(xué)的許多基本點(diǎn)。他發(fā)現(xiàn)了許多新性狀,并朝著繪制染色體圖邁開(kāi)步伐。
這樣,我和塔特姆都認(rèn)識(shí)到在我們的新的研究工作中,鏈孢菌幾乎是遺傳學(xué)上最理想的生物體。
(比德?tīng)枺?958,594~595)
雖然他倆還不清楚面包霉菌的營(yíng)養(yǎng)要求,但尼爾·弗賴(lài)斯肯定地對(duì)他們說(shuō)營(yíng)養(yǎng)要求是簡(jiǎn)單的。不久,塔特姆判明生物素是所要求的唯一的生長(zhǎng)因子,而且碰巧當(dāng)時(shí)這種激素的數(shù)量能滿(mǎn)足這些實(shí)驗(yàn)所需。
剩下的工作只是照射無(wú)性孢子,同相反接合型的菌株雜交;使之產(chǎn)生有性孢子,分離有性孢子;使之在適當(dāng)?shù)难a(bǔ)充培養(yǎng)基上生長(zhǎng),然后在非補(bǔ)充培養(yǎng)基上試驗(yàn)有性孢子。我們堅(jiān)信基因-酶反應(yīng)關(guān)系是普遍的,我們一定能找到我們所要的那些突變體。唯一擔(dān)憂(yōu)的是突變體的出現(xiàn)頻率可能極低,以致在發(fā)現(xiàn)它們之前我們很可能已失去信心而撒手不干了。
我們對(duì)長(zhǎng)期以來(lái)的挫折可能造成的泄氣極為關(guān)切。因此,在試驗(yàn)前我們?cè)谘a(bǔ)充培養(yǎng)基上準(zhǔn)備了一千多個(gè)單孢子培養(yǎng)物。我們從分離的299號(hào)和1085號(hào)孢子中分別得到了維生物B6和B1的突變株。我們立下誓言,不獲得10種突變體決不罷休。不久,我們竟獲得了幾十種突變體。
由于很容易重新獲得鏈孢菌一次減數(shù)分裂過(guò)程的全部產(chǎn)物,所以很容易斷定我們新誘發(fā)的營(yíng)養(yǎng)缺陷是否為單基因突變所造成的。如果是這樣,那么同原來(lái)的菌株雜交后,在每個(gè)子囊中應(yīng)有4個(gè)突變孢子和4個(gè)非突變孢子。結(jié)果確是如此。
經(jīng)歷了這樣長(zhǎng)期曲折的過(guò)程,我們先在果蠅中然后在鏈孢菌中,重新發(fā)現(xiàn)了好多年前加羅德已清楚觀察到的現(xiàn)象?,F(xiàn)在我們才了解加羅德的工作,并且認(rèn)識(shí)到我們?nèi)绻谠砩嫌行┌l(fā)展的話(huà),也是微乎其微的。我們用了更合意的生物體進(jìn)行研究,幾乎能隨意使任何一種化學(xué)反應(yīng)產(chǎn)生先天性代謝缺陷;通過(guò)培養(yǎng)基我們能供應(yīng)這些化學(xué)反應(yīng)的產(chǎn)物。所以,我們能驗(yàn)證加羅德已表明的人體內(nèi)有某些化學(xué)反應(yīng)就有某些基因的情況,同樣存在于鏈孢菌中,有許多化學(xué)反應(yīng)就有許多個(gè)基因。
(比德?tīng)枺?958,595~596)
除了在維生素B實(shí)驗(yàn)組中取得成果外,比德?tīng)柡退啬愤€確立了經(jīng)過(guò)氨基酸和吲哚生成色氨酸的基因控制下的反應(yīng)的次序。當(dāng)1942年戴維·邦納和諾曼·霍羅威茨加入他們的行列之后,觀察到的基因控制的生化反應(yīng)的范圍更廣泛了。到1945年,大約有60000個(gè)單孢子株系經(jīng)過(guò)X射線、中子和紫外線的照射。
一個(gè)基因一種酶假說(shuō)
比德?tīng)柡退啬吩?941年到1945年期間寫(xiě)的主要論文中,都沒(méi)有出現(xiàn)過(guò)“一個(gè)基因一種酶”的提法。在這個(gè)問(wèn)題上,他們采取比較謹(jǐn)慎的態(tài)度不是沒(méi)有理由的。在談到基因和酶的特異性時(shí),他們說(shuō),“是處于同一等級(jí)上”(1941,500),“在基因和特定反應(yīng)間存在著一一對(duì)應(yīng)的關(guān)系”(1945,643)。必須作進(jìn)一步研究來(lái)證明,是否“只是一個(gè)基因與直接調(diào)節(jié)一個(gè)特定化學(xué)反應(yīng)有關(guān)”(1941,505)。到1945年,比德?tīng)栭_(kāi)始討論基因與酶之間的關(guān)系了。他講到每一化學(xué)反應(yīng)主要受一個(gè)基因控制時(shí),他以歷來(lái)的講話(huà)風(fēng)格補(bǔ)充說(shuō):“更確切地說(shuō),是指每一種酶促催化反應(yīng)?!保?945,643)很清楚,盡管早期工作已提到基因與酶之間的關(guān)系,但只是研究了鏈孢菌中基因與反應(yīng)的關(guān)系之后才弄清楚的。
用比德?tīng)栮P(guān)于基因-酶之間關(guān)系的見(jiàn)解來(lái)分析他提出的蛋白質(zhì)合成概念,是一件饒有興趣的事。后面我們將簡(jiǎn)要地討論這個(gè)問(wèn)題。我們?cè)谶@里要提到的是比德?tīng)柎嬖谝环N矛盾心理,一方面他認(rèn)為有無(wú)起作用的酶取決于單個(gè)基因;而另一方面他又提出了包括酶在內(nèi)的最終產(chǎn)物的分步合成概念,即每一步取決于一個(gè)基因,因此總的合成就涉及許多個(gè)基因。這就導(dǎo)致他提出區(qū)分“初級(jí)”和“次級(jí)”基因控制的兩個(gè)方面。
基因表達(dá)學(xué)說(shuō)
很久以前就有人提出,細(xì)胞核對(duì)細(xì)胞質(zhì)的作用要由“酵素”(原文為ferment——譯者注)作媒介(德里施,1894)。到1902年,幾位早期的孟德?tīng)枌W(xué)者已把遺傳因子與酵素聯(lián)系起來(lái)。由于這種觀點(diǎn)得到廣泛承認(rèn),因此早先風(fēng)行一時(shí)的自體生殖粒子理論也就煙消云散了。十九世紀(jì)流行這種理論,是對(duì)蛋白質(zhì)之類(lèi)復(fù)雜分子缺乏了解的結(jié)果,也是認(rèn)識(shí)到自體生殖要求化學(xué)分子無(wú)法提供的更高級(jí)組織形式的結(jié)果。因此,赫伯特·斯潘塞、查爾斯·達(dá)爾文、雨果·德弗里斯和奧古斯特·魏斯曼提出了由許多化學(xué)分子組成的、自繁殖的生理學(xué)單位和形態(tài)學(xué)單位。
到二十世紀(jì),有人認(rèn)為基因復(fù)制是類(lèi)似晶體生長(zhǎng)的自動(dòng)催化過(guò)程(奧斯特瓦,1908;哈格多恩,1911)。因此,就不太強(qiáng)調(diào)要有老的形態(tài)學(xué)單位。荷蘭遺傳學(xué)家艾文特·哈格多恩在那篇極有創(chuàng)見(jiàn)的文章《自動(dòng)催化物質(zhì):遺傳性狀的定子——遺傳及進(jìn)化的生物力學(xué)理論》中,抨擊了生命有機(jī)體的所有亞單位都具有活力的老傳統(tǒng)。同以前的威廉·魯一樣,哈格多恩認(rèn)為生命應(yīng)是這些亞單位的組合體,而不是亞單位本身。
遺傳物質(zhì)是由原生質(zhì)組成并有同化作用和生長(zhǎng)能力的生命單位,這種假設(shè)是符合實(shí)際的。作為一種遺傳與進(jìn)化學(xué)說(shuō),我們還需了解更多的東西。工作假說(shuō)要成為有用的研究工具,必須用已經(jīng)掌握的材料來(lái)解釋這些事實(shí)。如果為解釋而解釋?zhuān)孟胂蟪鰜?lái)的生命粒子的行為來(lái)解釋進(jìn)化與遺傳事實(shí)則是不可接受的。
(哈格多恩,1911,23)
后來(lái),C.M.蔡爾德也提出類(lèi)似的觀點(diǎn),他認(rèn)為十九世紀(jì)的微粒學(xué)說(shuō)無(wú)助于“我們解決任何一個(gè)生物學(xué)基本問(wèn)題,它只能置這些問(wèn)題于科學(xué)研究的范圍之外”(1915,11~12)。特羅蘭也附和蔡爾德的觀點(diǎn),并對(duì)H.J.穆勒有很大影響。許多年之后,這位偉大的美國(guó)遺傳學(xué)家寫(xiě)道:
以前提出“泛生子”、“定子”或其他自繁殖粒子的人們,看來(lái)并未認(rèn)識(shí)到這些理論所造成的巨大危害。他們下意識(shí)地陷入了古代的萬(wàn)物有靈論……把繁殖看成是由于粒子的作用,特別是當(dāng)粒子構(gòu)成一個(gè)更大活體的組成時(shí)更是如此。
(穆勒,1951,95)
哈格多恩認(rèn)為自己的作用只是使魯和洛布表達(dá)的觀點(diǎn)現(xiàn)代化。根據(jù)這位荷蘭科學(xué)家的假說(shuō),遺傳機(jī)制涉及“為數(shù)眾多的、分別傳遞的物質(zhì),每一種物質(zhì)都具有自體催化的特點(diǎn)”(哈格多恩,1911,28)。特羅蘭欣然接受這一假說(shuō),因?yàn)樗吹竭@種假說(shuō)干凈利落地推翻了生命粒子說(shuō),并避免了無(wú)限倒退的問(wèn)題。他說(shuō),德里施曾
……論證說(shuō),要解釋決定發(fā)育的細(xì)胞核“機(jī)器”的繁殖,我們必須設(shè)想還有另一個(gè)機(jī)器來(lái)完成操作,依此類(lèi)推以至無(wú)窮。然而,自體催化過(guò)程的性質(zhì)表明,這個(gè)結(jié)論是錯(cuò)誤的。因?yàn)樽泽w催化能使特定單位的任何平面或線性嵌合體在質(zhì)量上分毫不差地進(jìn)行繁殖。
(特羅蘭,1917,343)
毫無(wú)疑問(wèn),這種基因復(fù)制的催化學(xué)說(shuō)合乎當(dāng)時(shí)的潮流。因?yàn)槟菚r(shí)是酶學(xué)的黃金時(shí)代。我們發(fā)現(xiàn),特羅蘭在1916年寫(xiě)了一篇題為《生命的酶學(xué)說(shuō)》的論文。1917年,他講到“我們所說(shuō)的生命”,本質(zhì)上是催化規(guī)律經(jīng)歷漫長(zhǎng)的地質(zhì)時(shí)期作用于膠體體系物質(zhì)的產(chǎn)物(特羅蘭,1917,327)。對(duì)他來(lái)說(shuō),所謂“活體”或“遺傳”的決定作用歸結(jié)到底是“催化”作用(同上)。貝特森的觀點(diǎn)則是遺傳傳遞的因子“本身不大可能是遺傳因子,而是它們存在的結(jié)果”(貝特森,1909,86),特羅蘭認(rèn)為這種說(shuō)法只是“無(wú)知”(1917,328)。貝特森仍沒(méi)回答這兩個(gè)問(wèn)題:“因子本身是什么?它們又來(lái)自何方?”但對(duì)特羅蘭來(lái)說(shuō)這很簡(jiǎn)單:“假定實(shí)在的孟德?tīng)栆蜃泳褪敲?,那么幾乎所有這些困難就蕩然無(wú)存了?!保ㄍ希?/p>
特羅蘭區(qū)分了基因合成其類(lèi)似物的催化作用(自體催化)和合成不同物質(zhì)的催化作用(異體催化)。雖然自體催化更為基本,但兩者都類(lèi)似晶體生長(zhǎng),晶體周?chē)牧?chǎng)從溶液中吸引一定形狀的分子。這是一個(gè)特定過(guò)程,分子越復(fù)雜其特異性也就越大。這種吸引就像費(fèi)希爾認(rèn)為的酶和底物之間的鎖和鑰匙的關(guān)系(同上,337)。
穆勒在晚年承認(rèn)這些觀點(diǎn)大大鼓舞了他。
我在1917年看到特羅蘭的著名論文時(shí)真是大吃一驚,因?yàn)槠渲杏性S多觀點(diǎn)同我的想法極其類(lèi)似。但有些概念還存在一些重大分歧。例如,我雖然相信在原生質(zhì)反應(yīng)中專(zhuān)一性酶的重要性和多樣性,以及它們的存在要取決于基因,但我認(rèn)為在基因和酶之間劃等號(hào)是不合邏輯的,而是要確立基因到底屬于哪一類(lèi)已知的化學(xué)物質(zhì)還為時(shí)過(guò)早。即使在精子里還有一種尚未分類(lèi)的殘留物質(zhì),而且已知的酶大多被認(rèn)為是蛋白質(zhì)。
(穆勒,1967,423~424)
事實(shí)上,特羅蘭已把基因與核酸等同起來(lái),并探索了當(dāng)時(shí)的化學(xué)技術(shù)還無(wú)法揭示的化學(xué)序列組成這個(gè)難題。結(jié)果得到了統(tǒng)計(jì)學(xué)上的平均組成(特羅蘭,1917,342)。
可惜的是,特羅蘭的觀點(diǎn)未能對(duì)實(shí)驗(yàn)有所啟示,但他的觀點(diǎn)使人們始終抱有希望:終有一天可用物理化學(xué)來(lái)解釋基因的生理作用和基因復(fù)制。他的這些觀點(diǎn)強(qiáng)調(diào)了基因的自體催化作用是生物學(xué)中最不可思議的謎。盡管特羅蘭的論文沒(méi)有像哈格多恩的論文那樣得到廣泛引用,但正是穆勒,反復(fù)提醒遺傳學(xué)家要注意基因的自體催化作用,并吸引物理學(xué)家轉(zhuǎn)入生物學(xué)來(lái)解決這個(gè)問(wèn)題。
比德?tīng)柕倪z傳決定概念
從比德?tīng)柕恼撐闹锌梢钥闯觯覀兩厦嬲劦降倪@些推測(cè)性想法對(duì)他并沒(méi)有什么影響。他比鼓吹基因自體催化和異體催化作用的任何人都來(lái)得謹(jǐn)慎,從不輕易發(fā)表自己的看法。斯科特-蒙克里夫、庫(kù)恩、梅爾徹斯、韋爾臺(tái)爾以及1939年時(shí)加羅德的看法引起了他的重視(也許是J.B.S.霍爾丹在1937年寫(xiě)的一篇文章,使比德?tīng)栕⒁獾搅思恿_德的研究工作)。1939年,比德?tīng)栐趷?ài)丁堡會(huì)議上宣讀的論文《激素產(chǎn)生的遺傳控制及其應(yīng)用》的結(jié)語(yǔ)中,很好地說(shuō)明了他的研究方法。他說(shuō),如果論文中講到的工作是重要的,那么這不是“因?yàn)樗鼘?zhuān)門(mén)告訴我們?cè)S多關(guān)于基因的作用,而是因?yàn)樗赡苤赋鲆环N研究方法。我們希望這種方法對(duì)遺傳學(xué)家和生化學(xué)家都會(huì)變得越來(lái)越有用”(比德?tīng)枺?939,61)。
六年后,比德?tīng)栐阪滄呔芯可先〉昧藢?shí)質(zhì)性進(jìn)展。用伯納德·斯特勞斯的話(huà)來(lái)說(shuō),就是“表明了基因與代謝作用之間的密切關(guān)系”(1960,6)。因此,比德?tīng)柛械剿F(xiàn)在能夠推測(cè)基因怎樣決定其最后產(chǎn)物。基因的直接產(chǎn)物是激素、酶或蛋白質(zhì)。那么,基因如何決定其產(chǎn)物呢?抗原特異性模型作為一種特定的分子構(gòu)象對(duì)比德?tīng)柺怯杏绊懙?。他?xiě)道:
由于在許多已知的事例中,抗原和酶的特異性似同基因特異性有直接關(guān)系,因此完全有理由設(shè)想,基因主要的、可能是唯一的功能在于決定蛋白質(zhì)分子的最后構(gòu)型。
假設(shè)有機(jī)體的每一種特定蛋白質(zhì)具有從基因那里復(fù)制出來(lái)的獨(dú)特構(gòu)型,那么,由蛋白質(zhì)決定其專(zhuān)一性的每一種酶將由于基因突變而被修飾或失活。這當(dāng)然意味著通常由這種酶催化的反應(yīng)將改變其速率或產(chǎn)物,或是完全被阻斷。
這種觀點(diǎn)并不意味基因直接“制造”蛋白質(zhì),不管蛋白質(zhì)是怎樣合成的和由什么組成的,這些成分本身一定是由酶催化的反應(yīng)所合成;從而又依賴(lài)于許多基因的作用。因此,合成單個(gè)蛋白質(zhì)分子也許至少有幾百個(gè)不同的基因參與其事。但是,最后的這個(gè)分子只對(duì)應(yīng)于其中的一個(gè)基因,我們把這個(gè)基因看成是起主要控制作用。
(比德?tīng)枺?945,660)
比德?tīng)柕暮献髡叽骶S·邦納在1945年冷泉港會(huì)議上發(fā)表了同樣的看法。他說(shuō):
目前,大家一致認(rèn)為,基因含有的核蛋白構(gòu)成了基因結(jié)構(gòu)中的主要成分。因此我們可預(yù)料,像其他蛋白質(zhì)一樣,基因也有特定的構(gòu)造;一個(gè)基因的構(gòu)造有它自身的特征。根據(jù)這些看法可得出下述觀點(diǎn):基因通過(guò)直接或間接地使反應(yīng)不可缺少的酶有一種特定的構(gòu)型,從而控制了生化反應(yīng)。
(邦納,1946,21)
貿(mào)然地說(shuō)這種基因作用概念會(huì)引入歧途,將是極不公正的。上述概念描繪了基因通過(guò)決定特定蛋白質(zhì)的構(gòu)象而專(zhuān)一性地起作用,這種概念在目前的蛋白質(zhì)合成學(xué)說(shuō)中仍占一席之地,因?yàn)榛虼_實(shí)決定氨基酸的順序,在一定的條件下該順序又決定蛋白質(zhì)的構(gòu)象。但是,比德?tīng)栐?945年的討論中沒(méi)有提及氨基酸順序,而且從亞單位裝配與最終構(gòu)象的區(qū)別來(lái)看,比德?tīng)柈?dāng)時(shí)肯定還沒(méi)有形成現(xiàn)在這樣的想法。如果可以說(shuō)上述概念已步入歧途,那么問(wèn)題出在得出的結(jié)論:基因是一種特殊的酶,因此其專(zhuān)一性作用在于它的蛋白質(zhì)成分。請(qǐng)看一下比德?tīng)栐?945年寫(xiě)的論文中的一段話(huà):
根據(jù)各方面的證據(jù),基因被認(rèn)為是由核蛋白所組成,或至少含有核蛋白作為主要成分。基因有復(fù)制自身的能力,當(dāng)然是每當(dāng)細(xì)胞分裂一次基因就復(fù)制一次。基因自我復(fù)制的方式是生物學(xué)中尚待解決的問(wèn)題之一,但人們認(rèn)為這涉及一種模型復(fù)制機(jī)制,由此基因把子基因的組成成分組合在一起。如果確是這種機(jī)制以及基因含有蛋白質(zhì)成分,則基因復(fù)制是蛋白質(zhì)合成的一個(gè)特例。
(比德?tīng)枺?945,660)
與病毒作類(lèi)比
凡讀過(guò)貢特·施滕特為《細(xì)菌病毒的分子生物學(xué)》所寫(xiě)歷史緒論的人都知道,噬菌體的發(fā)現(xiàn)觸發(fā)了一場(chǎng)辯論——致病因子是有機(jī)體還是酶?論戰(zhàn)的一方是巴黎巴斯德研究所所長(zhǎng)費(fèi)利克斯·德黑雷勒,他主張噬菌體是一種“看不見(jiàn)的微生物”(1917,373);另一方是安德烈·格雷希和布魯塞爾巴斯德研究所所長(zhǎng)朱爾斯·博爾德,他們支持另一種觀點(diǎn),認(rèn)為溶菌因子是細(xì)菌本身產(chǎn)生的一種酶。英國(guó)微生物學(xué)家弗雷德里克·特沃特認(rèn)為溶菌現(xiàn)象有三種可能的解釋?zhuān)@是其中之一(1915,1242)。對(duì)動(dòng)植物病毒來(lái)說(shuō),這種酶學(xué)說(shuō)是正統(tǒng)的看法。在1899年和1900年,正是A.F.伍茲用這種理論來(lái)解釋煙草花葉病毒(TMV)。壞死斑點(diǎn)中的葉綠素變成了葉黃素,這是由于局部積累了氧化酶。1905年,F(xiàn).W.T.亨格基本上也持同樣的觀點(diǎn)。在我們已提到的哈格多恩的文章中,把基因比作是引起狂犬病和脊髓灰質(zhì)炎的“濾過(guò)性病毒”。濾過(guò)性病毒只是“具有自體催化特性的化學(xué)物質(zhì)”,它們?nèi)鄙偌?xì)菌和酵母細(xì)胞的“結(jié)構(gòu)上的關(guān)系”,因此在通過(guò)極細(xì)的濾膜時(shí)不會(huì)喪失自體催化能力(哈格多恩,1911,26~27)。因此,濾過(guò)性病毒和噬菌體的發(fā)現(xiàn),有力地支持了生命的酶學(xué)說(shuō)和把自體催化看作是生命的基本而主要的特性的概念。哈格多恩并未排除這種可能性,“把濾過(guò)性病毒和其他自體催化物質(zhì)等非生命物組合起來(lái)創(chuàng)造出生命有機(jī)體”(1911,27)。
諾思羅普的噬菌體繁殖的自體催化學(xué)說(shuō)
1937年,諾思羅普在著名論文《噬菌體的濃縮和純化》中闡明了這一學(xué)說(shuō)。他發(fā)現(xiàn)自己正處于約四十年前巴克納同樣的境地,當(dāng)時(shí)巴克納已證實(shí)細(xì)胞抽提物會(huì)引起歷來(lái)認(rèn)為是“生命攸關(guān)的”反應(yīng)。只需要有釀酶存在,糖的發(fā)酵就成為一種化學(xué)反應(yīng)。接著便是噬菌體的發(fā)現(xiàn)。噬菌體在寄主細(xì)胞內(nèi)急劇增多,因此,它像是一種生命有機(jī)體。諾思羅普的論點(diǎn)又引起一場(chǎng)辯論。諾思羅普力圖制服活力論的新幽靈。他正確地論證了噬菌體及有可察覺(jué)的、有組織的結(jié)構(gòu)以及它自身的代謝作用。他沒(méi)有證據(jù)來(lái)證明噬菌體本身自體催化作用的增加。
……因?yàn)橹皇窃谟谢罴?xì)胞的情況下,自體催化才會(huì)增加,在這種情況下,細(xì)胞里正常的蛋白質(zhì)和酶也就增加。實(shí)際上,最近庫(kù)尼茨已發(fā)現(xiàn)霉菌(青霉菌)產(chǎn)生的細(xì)胞外水解蛋白酶也以同樣的方式增加。噬菌體與“正常的”酶或蛋白質(zhì)之間的差別,僅在于:不是所有的培養(yǎng)物都含有噬菌體。如果所有的培養(yǎng)物都含有噬菌體,那么就可認(rèn)為它是一種正常的酶,這種培養(yǎng)物可以說(shuō)是容易自溶的。
(諾思羅普,1938,359)
諾思羅普問(wèn)道,只有噬菌體會(huì)有自溶性的增加嗎?確實(shí)還有一些物質(zhì)在加到活細(xì)胞里以后也會(huì)增加。1922年格雷希指出,凝血期間凝血酶的增加類(lèi)似于細(xì)菌產(chǎn)生噬菌體。六年后,格里菲思發(fā)現(xiàn)了肺炎球菌的轉(zhuǎn)化現(xiàn)象。這不正是在Ⅲ型死細(xì)胞的刺激下生成一種新化合物——Ⅲ型外殼的一個(gè)例子嗎?失活的化合物胃蛋白酶原和胰蛋白酶原在有活性的酶存在時(shí)不是并未因此而在體外變成活性的胃蛋白酶和胰蛋白酶嗎?
可用相同的機(jī)制來(lái)說(shuō)明活細(xì)胞中噬菌體和其他病毒的增多。細(xì)胞合成了一種“正常的”失活蛋白質(zhì)。當(dāng)加入有活性的病毒或噬菌體時(shí),這種失活蛋白質(zhì)或“原噬菌體”被自體催化反應(yīng)轉(zhuǎn)化成更有活性的噬菌體。
(諾思羅普,1938,361)
早在1936年,斯坦利在研究TMV時(shí)就提出了這一學(xué)說(shuō)。當(dāng)然,當(dāng)時(shí)這一學(xué)說(shuō)還有些問(wèn)題呢!正如諾思羅普所承認(rèn)的,如果一種無(wú)活性蛋白質(zhì)變成活性蛋白質(zhì)要經(jīng)過(guò)水解從而使分子裂解,那么從超離心得到的TMV為什么有這么高的分子量(3×108)呢?F.C.鮑登(后來(lái)的弗雷德里克爵士)曾問(wèn)道,制造這些病毒前體對(duì)寄主細(xì)菌有什么好處?胃蛋白酶原在體外變?yōu)槲傅鞍酌竿删w前體轉(zhuǎn)化為噬菌體,在數(shù)量上又有什么類(lèi)似之處?在寄主細(xì)胞或煙草植株中,都找不到如此大量的諾思羅普所說(shuō)的“原噬菌體”。一點(diǎn)證據(jù)都沒(méi)有(鮑登,1939,280)。1937年,斯坦利不得不承認(rèn)TMV相對(duì)分子質(zhì)量超過(guò)10000000,但在健康的煙草汁中,他找不到相對(duì)分子質(zhì)量大于30000的粒子(威科夫、比斯科和斯坦利,1937)。
無(wú)所不包的生命酶學(xué)說(shuō)被用來(lái)反對(duì)噬菌體的活力論。正如諾思羅普所承認(rèn)的,他提出的看法類(lèi)似于博安德在1931年和斯坦利在1936年提出的觀點(diǎn)。洛克菲勒研究所的這個(gè)“酶大本營(yíng)”似乎并未受到穆勒提出的病毒基因類(lèi)似論的影響。穆勒是在1921年于多倫多召開(kāi)的美國(guó)科學(xué)發(fā)展協(xié)會(huì)的會(huì)議上,第一次提出病毒-基因類(lèi)似論,并在1929年和1936年再次提出。在1921年的會(huì)議上,他論證說(shuō):
……如果這些德黑雷勒小體確是完全像染色體基因一樣的基因,那就為解決基因問(wèn)題指出一條全新的途徑。它們是濾過(guò)性的,可在某種程度上分離的,可在試管里處理的;經(jīng)處理后,就可以研究它們作用于細(xì)菌所表現(xiàn)出來(lái)的那些特性。稱(chēng)這些小體為基因是過(guò)于輕率了,但目前我們又必須承認(rèn)在基因與這些小體之間,還不知道有什么差別。因此我們不能斷然否認(rèn),也許我們能夠在研缽和燒杯內(nèi)研磨和燒煮基因呢。難道我們這些遺傳學(xué)家一定要成為細(xì)菌學(xué)家、生理化學(xué)家和物理學(xué)家,同時(shí)又是動(dòng)物學(xué)家和植物學(xué)家嗎?但愿我們能夠如此。
(穆勒,1922,48;引自卡爾森1971,162)
1936年,穆勒提到了斯坦利的晶狀TMV產(chǎn)物,這“顯然”是一種純蛋白質(zhì)。
我們斷定,這種物質(zhì)具有基因的性質(zhì),即能自體繁殖。也就是說(shuō),當(dāng)它在細(xì)胞里時(shí)能自體合成,而且可能是能突變的,因?yàn)橹胁煌姆N類(lèi)。因此我們可以暫時(shí)假定它代表了某種基因。它的巨大分子的相對(duì)分子質(zhì)量達(dá)幾百萬(wàn),十分接近于現(xiàn)在估算的果蠅基因的大小。
(穆勒,1936,213)
在愛(ài)丁堡舉行的遺傳學(xué)會(huì)議上,阿斯特伯里宣讀了題為《與基因問(wèn)題有關(guān)的蛋白質(zhì)和病毒研究》的論文。在這篇論文中,他宣稱(chēng):“病毒和染色體是我們所知道的兩種最簡(jiǎn)單的繁殖系統(tǒng)——‘最簡(jiǎn)單’是指它們最接近于生命的起點(diǎn)。”(阿斯特伯里,1939,49)在這次會(huì)議上,H.H.麥金尼和J.W.高恩也講到了病毒粒子與基因的相似性。麥金尼論文的題目是《病毒基因》。他認(rèn)為,TMV
……具有基因的基本功能,即它在自我復(fù)制(自體合成)的特定反應(yīng)中起決定者的作用。而且它發(fā)生突變,形成一系列來(lái)自野生型的等位基因。根據(jù)化學(xué)實(shí)驗(yàn)得出結(jié)論認(rèn)為,基因是寄生的核蛋白,這一結(jié)論與上述觀點(diǎn)并不抵觸。
(麥金尼,1939,202)
承認(rèn)病毒是核蛋白所組成以及病毒-基因的相似性,并未推翻生命的酶學(xué)說(shuō)和中心法則的蛋白質(zhì)版本。相反,我們現(xiàn)在認(rèn)為是相互抵觸的證據(jù),在持續(xù)了整整十年的假說(shuō)中卻協(xié)調(diào)一致了。
基因作為接合蛋白質(zhì)
分子的特異性及復(fù)制能力存在于分子的哪一部分,這個(gè)問(wèn)題也許是離題的。這正是杰克·舒爾茨在1941年冷泉港會(huì)議上提出的論文《基因的核蛋白性質(zhì)的證據(jù)》的結(jié)論。他把基因起到接合蛋白的作用,比作是1938年奧托·沃伯格講到的在呼吸中起作用的核蛋白酶。舒爾茨在這篇論文中說(shuō):“活性基因是接合蛋白;要起作用兩種成分缺一不可……基因的專(zhuān)一性在于核蛋白之中,染色體的連續(xù)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)纖維?!保?941,62)
到了二十世紀(jì)四十年代,不再是直截了當(dāng)?shù)貭?zhēng)論把蛋白質(zhì)還是把核酸看作遺傳物質(zhì),但蛋白質(zhì)還是核蛋白是遺傳物質(zhì)存在不同看法。如果遺傳特異性不能只歸因于蛋白質(zhì),那么也不能只歸因于核酸。然而,從整體上來(lái)說(shuō)遺傳信息的貯存仍然與蛋白質(zhì)部分有關(guān),這種物質(zhì)的表達(dá)和復(fù)制離不開(kāi)核酸部分。1953年以后,仍長(zhǎng)期持有這種論點(diǎn)在理查德·戈德施米特的著作里有透徹的陳述。人們也許期望這位偉大的生物化學(xué)家和動(dòng)態(tài)遺傳學(xué)家很樂(lè)意接受沃森-克里克在1953年提出的模型。戈德施米特沒(méi)有這樣做,這證明需要作“詞形變換”。他顯然是堅(jiān)信我們所說(shuō)的“中心法則的蛋白質(zhì)版本”。1955年,他稱(chēng)沃森-克里克模型為“獨(dú)創(chuàng)的”和“有很好的實(shí)驗(yàn)根據(jù)的”(1955,37),但他又肯定地對(duì)讀者說(shuō),遺傳學(xué)家
……不會(huì)滿(mǎn)足于把自我復(fù)制的一種解釋作為DNA是遺傳物質(zhì)的證據(jù)。作為證據(jù),一定要與所有生化的、遺傳的和細(xì)胞學(xué)的事實(shí)符合一致……而且不能有其他解釋。
顯然,很容易推翻這一理論并得出結(jié)論說(shuō)DNA分子是使蛋白質(zhì)基因物質(zhì)處于復(fù)制位置上的骨架……這種物質(zhì)的以前的模型,常常假定黏稠的DNA纖維有這種功能。
(戈德施米特,1955,40~41)
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