政策與政府權(quán)威是政府合法性的重要來源，政策沖突使政策不能順利地貫徹執(zhí)行對(duì)政策和政府的權(quán)威造成破壞。如在中央政策與地方政策沖突中，地方政府對(duì)中央政策的象征執(zhí)行、敷衍執(zhí)行、選擇執(zhí)行、附加執(zhí)行等使中央政策得不到貫徹，有損中央政策的權(quán)威。公共政策的合法性是人們接受、認(rèn)同、服從政策的基礎(chǔ)，人們認(rèn)為公共政策是合法的、公正的，才會(huì)認(rèn)為政策是可服從的，否則會(huì)對(duì)政策產(chǎn)生懷疑。公共政策的科學(xué)性、合法性增強(qiáng)政府的合法性和權(quán)威，反過來，政策沖突、政策失效等損害政府權(quán)威和合法性。政策沖突易造成各個(gè)地區(qū)、各個(gè)部門各自為政的現(xiàn)象，表現(xiàn)為政策的支離破碎，一個(gè)地區(qū)或部門出臺(tái)的政策只能在本地區(qū)或本部門的小范圍內(nèi)適用，使一些政策形同虛設(shè)。首先，利益結(jié)構(gòu)的分化導(dǎo)致公共政策執(zhí)行過程中缺乏權(quán)威性。在社會(huì)主義市場經(jīng)濟(jì)條件下各利益主體追求利益最大化而參與市場競爭，而不同地域、不同層次、不同性質(zhì)的競爭主體的利益要求是不同的，各利益主體為了維護(hù)自身的利益易忽視政策的執(zhí)行，損害政策的權(quán)威性。其次，政策沖突體現(xiàn)政策制定過程中缺乏合理性和合法性，損害政策權(quán)威。公共政策制定的合法性、科學(xué)性、穩(wěn)定性和協(xié)調(diào)性是公共政策獲得權(quán)威性的前提，相互沖突的政策體現(xiàn)出政策制定過程中缺乏科學(xué)、合理的論證，容易導(dǎo)致政策執(zhí)行的失敗，使政策的權(quán)威性受到破壞。最后，一些政策主體素質(zhì)偏低，制定政策過程中缺乏科學(xué)性，受錯(cuò)誤政績觀的影響盲目制定一些政策，導(dǎo)致政策沖突，政策多變等，損害政策的權(quán)威性。而政策的權(quán)威性與政府的權(quán)威性息息相關(guān)，公眾對(duì)政策權(quán)威性的質(zhì)疑累積起來最終會(huì)破壞政府的權(quán)威性。