（1）內(nèi)部審計(jì)機(jī)構(gòu)的相對(duì)獨(dú)立性。

內(nèi)部審計(jì)機(jī)構(gòu)是單位內(nèi)設(shè)機(jī)構(gòu)，在本單位負(fù)責(zé)人的領(lǐng)導(dǎo)下開(kāi)展工作，為本單位實(shí)現(xiàn)經(jīng)營(yíng)目標(biāo)服務(wù)。因此，內(nèi)部審計(jì)的獨(dú)立性不如外部審計(jì)，在審計(jì)過(guò)程中，不可避免地受本單位的利益限制。內(nèi)部審計(jì)的組織形式也反映出其獨(dú)立性的弱化：有的單位把審計(jì)機(jī)構(gòu)設(shè)在財(cái)會(huì)部門中；有的單位把審計(jì)機(jī)構(gòu)和監(jiān)察部門合并在一起；有的單位由分管錢財(cái)物資及賬目的人員兼任審計(jì)崗位；有的單位領(lǐng)導(dǎo)既領(lǐng)導(dǎo)財(cái)會(huì)工作，又領(lǐng)導(dǎo)審計(jì)工作。因此，企業(yè)的內(nèi)部審計(jì)很難站在客觀、公允的立場(chǎng)上對(duì)企業(yè)的財(cái)務(wù)狀況作出客觀、公正的評(píng)價(jià)。特別是當(dāng)面對(duì)領(lǐng)導(dǎo)參與或法人違規(guī)時(shí)，內(nèi)部審計(jì)往往無(wú)能為力。在這種情況下，作為企業(yè)的內(nèi)部審計(jì)部門，如若服從于領(lǐng)導(dǎo)意志，不能對(duì)企業(yè)的財(cái)務(wù)狀況進(jìn)行有效監(jiān)控，不能作出真實(shí)、客觀的評(píng)價(jià)，而出具虛假審計(jì)報(bào)告，就會(huì)埋下巨大的隱患。獨(dú)立性是審計(jì)工作的靈魂。不能有效保證審計(jì)機(jī)構(gòu)和人員在組織上的獨(dú)立性及其在業(yè)務(wù)工作中的自主性和權(quán)威性，就不能保證審計(jì)質(zhì)量和規(guī)避審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)。

（2）內(nèi)部審計(jì)對(duì)象和內(nèi)容的復(fù)雜性。

隨著國(guó)有企業(yè)改制、重組，內(nèi)部審計(jì)的對(duì)象和內(nèi)容也日益復(fù)雜；審計(jì)對(duì)象逐步發(fā)展為企業(yè)集團(tuán)、股份公司和連鎖經(jīng)營(yíng)店，企業(yè)內(nèi)部機(jī)構(gòu)層次增加，所進(jìn)行的交易日趨復(fù)雜；被審單位與集團(tuán)公司是母子公司或聯(lián)營(yíng)公司的關(guān)系，在兼并和收購(gòu)、改制和改組、聯(lián)合和剝離及分拆中，給內(nèi)部審計(jì)帶來(lái)了更多的困難，審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)也隨之增加。另一方面，內(nèi)部審計(jì)的內(nèi)容從傳統(tǒng)的財(cái)務(wù)審計(jì)發(fā)展為效益審計(jì)、管理審計(jì)、經(jīng)濟(jì)責(zé)任審計(jì)、決策審計(jì)、風(fēng)險(xiǎn)審計(jì)、投資審計(jì)等，這對(duì)內(nèi)部審計(jì)人員提出了更高的要求，審計(jì)人員作出正確結(jié)論的難度也就越大，審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)隨之增大。

（3）內(nèi)部審計(jì)法規(guī)不健全，人員素質(zhì)亟待提高。

內(nèi)部審計(jì)法律依據(jù)不充分、不健全，或出現(xiàn)空白，使得內(nèi)部審計(jì)人員在進(jìn)行審計(jì)時(shí)，只有依據(jù)經(jīng)驗(yàn)和知識(shí)進(jìn)行分析判斷，在某種程度上影響了審計(jì)結(jié)論的權(quán)威性，因而增大了審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)。同時(shí)，目前我國(guó)內(nèi)部審計(jì)人員整體水平不高，綜合素質(zhì)較低，識(shí)別風(fēng)險(xiǎn)、判斷正誤的能力較差；有些人員職業(yè)道德欠佳，不能經(jīng)受各方面的誘惑；有些人員缺乏計(jì)算機(jī)審計(jì)技能，不能適應(yīng)新形勢(shì)的需要。這將給內(nèi)部審計(jì)工作的質(zhì)量、信譽(yù)帶來(lái)負(fù)面影響，從而導(dǎo)致審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)的出現(xiàn)。

（4）內(nèi)部審計(jì)方法滯后，質(zhì)量控制制度不完善。

我國(guó)內(nèi)部審計(jì)方法仍以賬項(xiàng)基礎(chǔ)審計(jì)方法為主，主要審計(jì)目的是“查錯(cuò)防弊”，內(nèi)部審計(jì)人員風(fēng)險(xiǎn)觀念淡薄，審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)控制因素考慮較少，更談不上運(yùn)用最新的以風(fēng)險(xiǎn)導(dǎo)向?yàn)楹诵牡膶徲?jì)方法來(lái)防范和化解風(fēng)險(xiǎn)。內(nèi)部審計(jì)中抽樣技術(shù)雖已被廣泛應(yīng)用，但是內(nèi)部審計(jì)人員在運(yùn)用這一技術(shù)時(shí)，基本上全憑審計(jì)人員的主觀標(biāo)準(zhǔn)和經(jīng)驗(yàn)來(lái)確定樣本規(guī)模和評(píng)價(jià)樣本結(jié)果，這種判斷抽樣極易遺漏重要事項(xiàng)，形成審計(jì)風(fēng)險(xiǎn)。

同時(shí)，目前許多企業(yè)內(nèi)部審計(jì)制度不完善，如審計(jì)機(jī)構(gòu)缺少事前的審計(jì)計(jì)劃、事中的審計(jì)程序和報(bào)告期的審計(jì)復(fù)核；審計(jì)工作底稿不完整，一般僅記錄審計(jì)問(wèn)題事項(xiàng)，而未記錄審計(jì)人員認(rèn)為正確的審計(jì)事項(xiàng)，使得審計(jì)復(fù)核、審計(jì)質(zhì)量控制無(wú)從入手；審計(jì)報(bào)告以協(xié)調(diào)關(guān)系為出發(fā)點(diǎn)，以肯定工作成績(jī)?yōu)榛{(diào)，問(wèn)題定性模棱兩可。這都使內(nèi)部審計(jì)質(zhì)量得不到保證，更談不上防范風(fēng)險(xiǎn)。