法和丙酮法沉淀濃縮蛋白質(zhì)
實(shí)驗(yàn)十四 TCA法和丙酮法沉淀濃縮蛋白質(zhì)
【實(shí)驗(yàn)?zāi)康摹?/p>
1.了解TCA法和丙酮法沉淀濃縮蛋白質(zhì)的原理。
2.了解TCA法和丙酮法沉淀蛋白質(zhì)的優(yōu)缺點(diǎn)。
【實(shí)驗(yàn)原理】
蛋白質(zhì)能被某些有機(jī)溶劑沉淀下來,一方面是由于甲醇、乙醇、丙酮等有機(jī)溶劑加入水中使溶劑介電常數(shù)降低,增加了相反電荷的吸引力,另一方面是因?yàn)檫@些有機(jī)溶劑是強(qiáng)親水試劑,爭奪蛋白質(zhì)分子表面的水化水,破壞蛋白質(zhì)膠體分子表面的水化層而使分子聚集沉淀。在等電點(diǎn)時(shí)沉淀效果更好。
常溫下有機(jī)溶劑可使蛋白質(zhì)變性,低溫條件下可減慢變性速度。因此用有機(jī)溶劑沉淀蛋白質(zhì)時(shí)應(yīng)在低溫條件下進(jìn)行。如利用丙酮沉淀蛋白質(zhì)時(shí),必須在0~4℃低溫下進(jìn)行。蛋白質(zhì)被丙酮沉淀后,應(yīng)立即分離,否則蛋白質(zhì)會(huì)變性。
三氯乙酸(TCA)沉淀蛋白質(zhì)主要基于以下幾個(gè)方面的作用:①在酸性條件下TCA能與蛋白質(zhì)形成不溶性鹽;②TCA作為蛋白質(zhì)變性劑使蛋白質(zhì)構(gòu)象發(fā)生改變,暴露出較多的疏水性基團(tuán),使之聚集沉淀。
【實(shí)驗(yàn)器材】
1.5 ml離心管、5 ml離心管、移液槍、冷凍高速離心機(jī)、冷凍干燥離心機(jī)等。
【藥品試劑】
1.蛋白質(zhì)溶液。
2.20%TCA。
3.丙酮。
4.PBS磷酸緩沖液。
【實(shí)驗(yàn)方法】
1.TCA沉淀法:
(1)取500μl蛋白溶液,加入等體積預(yù)冷的20%TCA溶液,立刻混勻。
(2)冰上放置30分鐘。
(3)4℃,13200 r/min離心15分鐘。
(4)小心去除上清液,冷凍干燥沉淀,約1小時(shí)。
(5)加入50μl PBS溶解沉淀,280 nm測定蛋白質(zhì)濃度。2.丙酮沉淀法:
(1)在-20℃預(yù)冷丙酮溶液。
(2)500μl蛋白液放置于5 ml管中,加入3 ml預(yù)冷丙酮,迅速混勻,-20℃放置2小時(shí)以上或過夜。
(3)4℃,13200 r/min離心15分鐘。
(4)小心棄去上清液,注意勿接觸沉淀。加入100 ml冷的90%丙酮洗滌沉淀,4℃,13200 r/min離心5分鐘。
(5)重復(fù)上一步再次洗滌沉淀。
(6)棄去上清液,空氣中干燥沉淀15~30分鐘。
(7)加入適量PBS溶解蛋白質(zhì)沉淀。
【注意事項(xiàng)】
1.TCA沉淀法不適于大分子量蛋白質(zhì)。因?yàn)殡S著蛋白質(zhì)分子量的增大,其結(jié)構(gòu)復(fù)雜性與致密性也增大,TCA可能滲入分子內(nèi)部而使之較難被完全除去,在電泳前樣品加熱處理時(shí)可能使蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)發(fā)生酸水解而形成碎片,而且隨時(shí)間的延長這一作用愈加明顯。
2.含有TCA的蛋白質(zhì)進(jìn)行電泳時(shí),會(huì)因?yàn)門CA的結(jié)合使SDS與蛋白質(zhì)的結(jié)合量產(chǎn)生偏差,從而造成蛋白質(zhì)所帶電荷的不均一性,造成遷移率的不一致,從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)條帶出現(xiàn)展寬現(xiàn)象。
3.用TCA法對小分子量蛋白質(zhì)進(jìn)行濃縮,樣品處理后要盡快進(jìn)行電泳分析,以免發(fā)生聚集及斷裂,造成結(jié)果分析的不準(zhǔn)確。
4.如果待濃縮的蛋白質(zhì)含量過少,如小于幾微克,可按每個(gè)樣品10μg的量加入胰島素作為輔助蛋白質(zhì)幫助蛋白質(zhì)沉淀濃縮。
5.丙酮沉淀法適合從大多數(shù)水相溶劑中或者混有SDS的緩沖液中抽提蛋白質(zhì),不適于抽提在尿素或胍類變性溶液中的蛋白質(zhì)。
6.注意丙酮沉淀法需在丙酮不能溶解的容器中進(jìn)行,如polypropylene。
7.TCA法和丙酮法可以結(jié)合使用,即先用TCA沉淀,然后用冷丙酮洗滌沉淀,抽提TCA。
【思考題】
試比較分析TCA法和丙酮法沉淀濃縮蛋白質(zhì)的優(yōu)缺點(diǎn)。
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