4．1．4　分子化石與其他生物化石的比較

分子化石是生物有機(jī)體遺留下來(lái)的化學(xué)成分痕跡。大部分分子化石難以像生物實(shí)體化石(大化石和微體化石)一樣可以與特定的生物種乃至亞種聯(lián)系起來(lái)，在地質(zhì)體定年、地層劃分和對(duì)比方面遠(yuǎn)比不上這些實(shí)體化石。而且，許多分子化石像油氣一樣易于運(yùn)移，同時(shí)，還受到成巖作用等的強(qiáng)烈影響。盡管如此，分子化石在地球科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用還是有其獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。

4．1．4．1　分布的廣泛性

在某種程度上來(lái)說(shuō)，分子化石比生物實(shí)體化石容易保存，特別是其中的類(lèi)脂物分子化石，幾乎在所有的沉積巖中都可以見(jiàn)到，甚至在許多變質(zhì)巖中還可以存在。這樣，在那些缺乏其他生物化石的“啞”地層，或者在那些有生物化石(如孢粉)但沒(méi)有統(tǒng)計(jì)意義的地方，分子化石還能夠存在，可以開(kāi)展分子地層學(xué)工作。由于分子化石在許多“啞”地層中都能找到，可以成為解決地層學(xué)問(wèn)題的新工具，分子地層學(xué)有很大的發(fā)展前途。

4．1．4．2　定量的準(zhǔn)確性

分子化石的定量比較準(zhǔn)確，許多有實(shí)際地質(zhì)意義的指標(biāo)可以定量化，可以計(jì)算出諸如C3和C4植物的豐度比值、木本和草本植物的豐度比值、菌藻低等生物和高等植物的豐度比值等。而且，分子化石往往是一系列的同系物，各種指標(biāo)可以互相驗(yàn)證、互相補(bǔ)充。雖然孢粉分析也可以統(tǒng)計(jì)出木本植物和草本植物的相對(duì)變化，但它實(shí)際上是一種統(tǒng)計(jì)意義上的數(shù)值，而且，孢粉往往是有許多異地分子的混入(分子化石有時(shí)還可以把異地源和原地源區(qū)分開(kāi)來(lái))。菌藻低等生物和高等植物的豐度比值在恢復(fù)古氣候等與全球變化有關(guān)方面有重要的實(shí)際意義，但在一般沉積巖中，要利用其他生物化石計(jì)算出該比值相當(dāng)困難，甚至是不可能的，然而分子化石要做到這一點(diǎn)卻很容易。

4．1．4．3　應(yīng)用的指紋性

生物實(shí)體化石屬種的確定主要是基于形態(tài)學(xué)研究，是形態(tài)種。分子化石主要基于其化學(xué)成分和基因，是化學(xué)種(或分子種)。這兩個(gè)類(lèi)型的種不完全相同。現(xiàn)代生物學(xué)中就有很多形態(tài)種不變而化學(xué)成分發(fā)生變化的例子。當(dāng)生物生活環(huán)境條件發(fā)生長(zhǎng)期微小的變動(dòng)時(shí)，與環(huán)境有關(guān)的某些類(lèi)脂物將會(huì)隨之發(fā)生變化，但不會(huì)引起植物群落或生態(tài)系統(tǒng)的取代。只有當(dāng)環(huán)境壓力超過(guò)了生態(tài)系統(tǒng)的緩沖能力時(shí)，才會(huì)出現(xiàn)植被的變更。因此，某些分子種在反映環(huán)境條件變化上可能比形態(tài)種更加靈敏。而且，如前所述，分子化石具有多個(gè)系列的同系物，一些分子化石對(duì)環(huán)境的微小變化反映靈敏，另外一些則可能主要受控于植被狀況(其本身也間接地與比較大的環(huán)境條件變化有關(guān))。因此，一方面，那些與環(huán)境有關(guān)的類(lèi)脂物分子化石將直接記錄環(huán)境條件的微小變化;另一方面，某些分子化石和其他生物化石一樣，又記錄了植被景觀(以及相應(yīng)比較大的環(huán)境條件的變化)。這可在下面的泥炭例子中清晰地反映出來(lái)。分子化石在記錄全球變化(環(huán)境、氣候、植被)方面可能會(huì)有更好的指紋性效果。當(dāng)前趨勢(shì)是強(qiáng)調(diào)單個(gè)分子化石(尤其是類(lèi)脂物分子)的界面過(guò)程，特別是其同位素地球化學(xué)特征。分子界面過(guò)程能有效地研究開(kāi)放系統(tǒng)間的物質(zhì)、能量與信息的交換，它實(shí)際上是系統(tǒng)間接口的研究，能為地史時(shí)期的層圈關(guān)系研究提供很好的依據(jù)。

分子化石作為一種指紋性指標(biāo)，在油氣地球化學(xué)的油源、油油對(duì)比研究中得到了最充分的體現(xiàn)，它不僅可以反映沉積—成巖環(huán)境的變化，還可以記錄在沉積以后發(fā)生的一些后期地質(zhì)作用。