基因組學(xué)_分子生物學(xué)練習(xí)

二十三、基因組學(xué)

1.什么是開放閱讀框(ORF)？請寫出含有一段短的開放閱讀框的DNA序列。

2.什么是YAC載體的基本元件？

3.BAC是以哪種質(zhì)粒為基礎(chǔ)而構(gòu)建的？哪些元件是BAC所必需的？

4.比較大基因組的克隆-克隆測序策略和鳥槍法測序策略。

5.簡述在基因組中尋找STS序列的步驟。

6.什么是微衛(wèi)星DNA和小衛(wèi)星DNA？為什么在繪制連鎖遺傳圖譜時微衛(wèi)星DNA比小衛(wèi)星DNA更適用？

7.怎樣運用一套BAC克隆中的STSs來構(gòu)建一個毗連群，請用不同于教材中的示意圖進行說明。

8.怎樣運用放射性雜交圖譜對STSs進行作圖。

9.表達序列標簽(EST)與普通的STS有何不同？

10.從人類第22號染色體的序列可以得出哪些主要結(jié)論？

11.從人類第21號染色體的序列可以得出哪些主要結(jié)論？

12.比較“結(jié)構(gòu)基因組”和“功能基因組”。

13.如何制備DNA芯片(寡核苷酸陣列)？

14.制備一個DNA芯片，要求其中兩點中含有二核苷酸AC和AT，試說明制備步驟(可以忽略其他的點)。

15.設(shè)計一個實驗：要求應(yīng)用DNA微陣列或者DNA芯片來衡量在病毒感染細胞的兩個階段中病毒基因的轉(zhuǎn)錄情況，并說明范例結(jié)果。

16.怎樣用一個SAGE實驗來檢測某種類型癌細胞的轉(zhuǎn)錄情況。請說明雙標產(chǎn)物在此實驗中的作用，并給出在此實驗中所用的序列。

17.通過外顯子陷阱(exontrap)能否檢測到以下的DNA片段，為什么？(a)內(nèi)含子(b)外顯子的一部分(c)一個完整外顯子，在兩端有部分內(nèi)含子(d)一個完整外顯子，在一端有部分內(nèi)含子

18.列舉三種在megaYAC克隆中檢測某個基因的方法。

19.(1)哪種突變引起了亨廷頓綜合征？

(2)什么證據(jù)證明HD基因的突變導(dǎo)致亨廷頓綜合征？

20.以下是通過RFLP方法對某一區(qū)域進行分析后得出的物理圖譜。有數(shù)字標注的垂直線表示SmaI酶切位點，在2和3處(帶圓圈)具有多態(tài)性的，1和4則不具有多態(tài)性。這段DNA經(jīng)SmaI酶切后所產(chǎn)生的片段經(jīng)電泳分離后轉(zhuǎn)移到膜上，再與DNA探針(其大小及位置如圖所示)進行雜交。根據(jù)下表中的信息，寫出在各個單模標本所檢測到的帶的大小。

21.對某種遺傳疾病的基因進行作圖，發(fā)現(xiàn)該基因與RFLP中的一個名為X-21的探針連鎖，用標記的X-21探針與一組人鼠雜交細胞的DNA進行雜交。下面是雜交結(jié)果，并顯示了A～F組的雜交細胞含有的人染色體。請問是哪條人染色體含有該基因？

22.(1)哪種CF突變在囊腫性纖維化中最為普遍？

(2)有哪些證據(jù)證明編碼CFTR的基因確實是CF？

23.什么是SNPs(單核苷酸多態(tài)性)？為什么絕大多數(shù)SNPs并不重要，只有少數(shù)有用？

24.請比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)中所用技術(shù)及所含信息的異同。

參考書：

1.RobertF，Weaver.Molecular，Biology(SecondEdition)

2.GeorgeM，Malacinski，DavidFreifelder.EssentialofMolecularBiology(影印版).科學(xué)出版社

3.Lodish，Berk，Zipursky，Matsudaira，Baltimore，Darnell.MolecularcellBiology(FourthEdition)

4.郜金榮，葉林柏.分子生物學(xué)(第二版).武漢大學(xué)出版社