四、監(jiān)測(cè)環(huán)境中特定微生物的存在及其動(dòng)態(tài)

傳統(tǒng)的微生物分離鑒定耗時(shí)費(fèi)力，難以進(jìn)行，而分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展提供了新的對(duì)環(huán)境中微生物檢測(cè)、監(jiān)測(cè)的新的技術(shù)和理論方法。這里所說(shuō)的監(jiān)測(cè)是對(duì)已知和已認(rèn)識(shí)微生物的監(jiān)測(cè)與跟蹤。

研究方法是首先從環(huán)境樣品直接提取總DNA，經(jīng)PCR擴(kuò)增(特異或通用引物)得到含有某一高變區(qū)或代表區(qū)序列產(chǎn)物，通過(guò)DGGE得到帶譜。用種或類群專一性探針與得到的條帶進(jìn)行雜交或?qū)l帶切下，重新擴(kuò)增后測(cè)序，進(jìn)而得到條帶所反映的種類和種群存在的信息。

這種方法已被成功用于檢測(cè)環(huán)境中對(duì)生態(tài)過(guò)程起重要作用的細(xì)菌的存在，如研究中在得到DGGE帶譜后，將其印跡轉(zhuǎn)移到尼龍膜上并與硫還原細(xì)菌特異性探針進(jìn)行雜交，如與其中一樣品的帶譜出現(xiàn)了強(qiáng)烈的雜交信號(hào)，則表明環(huán)境中存在硫酸還原細(xì)菌。用PCR和RTPCR技術(shù)，準(zhǔn)確評(píng)價(jià)了惡臭假單胞菌ATCC11172菌在已有微生物系統(tǒng)中對(duì)脫酚效果的影響，并觀察了該菌的降解性基因在系統(tǒng)中表達(dá)的情況。

許多學(xué)者對(duì)細(xì)菌中的熒光基因(1ux gene)進(jìn)行克隆，轉(zhuǎn)移到具有分解能力的特種微生物體內(nèi)，具有分解能力的菌體中就有了特定的熒光標(biāo)記，通過(guò)對(duì)熒光菌和熒光量的監(jiān)測(cè)可以達(dá)到對(duì)專門細(xì)菌的跟蹤，并可以了解到它們與其他菌株之間在分解過(guò)程中的關(guān)系。