海洋細菌是數(shù)量最大、分布最廣的海洋微生物。

海洋細菌是原核微生物的一大類群，不含葉綠素和藻藍素，只能在海洋中生長、繁殖，是數(shù)量最大、分布最廣的海洋微生物。它們個體直徑一般不超過1微米，形狀有球狀、桿狀、螺旋狀或分枝絲狀，具有堅韌略具彈性的細胞壁，無真核。海洋中有自養(yǎng)和異養(yǎng)、光能和化能、好氧和厭氧、寄生和腐生，以及浮游和附著等類型的細菌。海洋真菌不超過500種，僅有陸地真菌種數(shù)的1%?，F(xiàn)知的深海真菌只有5種，它們能夠生活在水深5315米的海洋深處。

通過顯微鏡，我們可以看到海洋細菌的特征。它一共分為三種類型：體形近似球形的叫球菌；身體細長的是桿菌；體形彎曲的是螺旋菌。它們都屬于單細胞，內(nèi)部結(jié)構(gòu)與普通的植物細胞相似。如果細菌在適宜固體培養(yǎng)基表面或內(nèi)部生長繁殖到一定程度，就形成了肉眼可見的小群體，叫菌落。菌落帶有不同的顏色，如綠膿桿菌的菌落是綠色的，葡萄球菌的菌落是金黃色的。細菌菌落的形狀、大小和顏色等特點，是鑒別菌種的重要依據(jù)。

2．海洋真菌

從生物進化史看，海洋真菌的出現(xiàn)要比細菌大約晚10億年，因此它是微生物王國中最年輕的家族。真菌由多細胞絲結(jié)構(gòu)，能產(chǎn)生孢子進行有性和無性繁殖。真菌和細菌、放線菌最根本的區(qū)別在于它擁有真正的細胞核，因此真菌的細胞又稱為真核細胞。從原核細胞發(fā)展到真核細胞，是生物進化史上的一個重大事件。

大部分海洋真菌大多數(shù)棲于某種基物而生活，只有少數(shù)真菌不依賴基物而自由生活。根據(jù)海洋真菌的棲生習性，可將它劃分為五種基本的生態(tài)類型，分別為木生真菌、寄生藻體真菌、紅樹林真菌、海草真菌、寄生動物體真菌。

海洋真菌在海洋食物鏈中發(fā)揮著重要的作用，它參與海洋有機物質(zhì)的分解和無機營養(yǎng)物的再生過程，為海洋生物不斷提供生命所需的物質(zhì)。特別是在海洋沉積物中的真菌絲體和酵母菌體，是很多海洋動物的食物來源。有些海洋真菌能產(chǎn)生抗菌素和結(jié)構(gòu)獨特的活性物質(zhì)，在生態(tài)和應(yīng)用方面有著不可忽視的作用，如降解海洋中的污染物、促進海洋自凈等。利用海洋真菌加工麥皮、甘蔗渣、稻草等，可制成微生物碎屑混合物，用作水產(chǎn)養(yǎng)殖中的飼料。這種做法有可持續(xù)發(fā)展、質(zhì)量高、成本低廉等優(yōu)點。

3．病毒

海洋病毒是海洋生態(tài)系統(tǒng)中的重要成員，具有形態(tài)多樣性及遺傳多樣性的特征。海水中海洋病毒離海岸越近密度就越高。在海洋真光層中較多，隨海水深度增加逐漸減少，在靠近海底時又有回升的現(xiàn)象。

海洋中病毒會感染多種海洋生物。海洋噬菌體的裂解致死占異樣細菌死亡率的60%；海洋藍細菌、海洋真核藻等重要海洋初級生產(chǎn)者也會受到海洋病毒感染。病毒還能裂解某些種類浮游動物。眾所周知，病毒的感染致病，給水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)帶來了重大的影響。研究表明，從1993年開始在全國對蝦養(yǎng)殖地區(qū)普遍發(fā)生的、危害性極大的機型流行病，是由一種桿狀病毒所引起的。除了破壞性的一面，海洋病毒也有好的一面，有些海洋病毒能夠幫助某些海洋浮游植物生長，對海洋環(huán)境和人類生存有益。目前，人們已越來越關(guān)注海洋病毒在海洋生態(tài)系統(tǒng)中所發(fā)揮的作用。