從基礎(chǔ)做起
進(jìn)入致遠(yuǎn)生命科學(xué)班已經(jīng)有一段時(shí)間了,最初的好奇與期望也已變成現(xiàn)在對科學(xué)的向往和立志成才的追求。學(xué)院給予我們學(xué)生最雄厚的師資力量和良好的學(xué)習(xí)條件,讓我們的潛能得到最大程度的激發(fā)。在這里,我和同學(xué)們努力學(xué)習(xí)、合作討論、相互促進(jìn),感受積極的學(xué)術(shù)氣氛,踐行致遠(yuǎn)人的崇高使命。
——2010級(jí)生命科學(xué)方向李凱舟
暑假里很幸運(yùn)能到University of Wisconsin-Madison常強(qiáng)老師的實(shí)驗(yàn)室做暑期實(shí)習(xí)。我在閱讀了大量文獻(xiàn)資料后根據(jù)自己的興趣與導(dǎo)師商定科研計(jì)劃,最后我把課題確定為研究蛋白MeCP2磷酸化對成年小鼠神經(jīng)形成的影響,具體是在全基因組上定位蛋白MeCP2的結(jié)合位點(diǎn),再探究蛋白磷酸化對結(jié)合位點(diǎn)的改變。
剛到實(shí)驗(yàn)室,我就先從基本實(shí)驗(yàn)技術(shù)學(xué)起,掌握PCR、DNA跑膠、western blot和qPCR等實(shí)驗(yàn)。在這基礎(chǔ)上,我開始展開自己的項(xiàng)目,選擇蛋白MeCP2的結(jié)合熱點(diǎn),獲得DNA序列,設(shè)計(jì)引物,做qPCR,之后再統(tǒng)計(jì)分析數(shù)據(jù)。之前實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)得到了通過ChIP-seq建立的小鼠蛋白MeCP2結(jié)合位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫,但是我們不能確認(rèn)數(shù)據(jù)庫的可靠性,因?yàn)镃hIP-seq有其自身的局限性,而且得到的DNA量很少,需要先擴(kuò)增數(shù)量才能再進(jìn)行檢測,但在擴(kuò)增的過程中本身就已經(jīng)改變了各序列的占有比例,所以我所做的就是通過qPCR核實(shí)數(shù)據(jù)庫真實(shí)性,只有在確認(rèn)其正確性的前提下我們才能放心地使用ChIP-seq的數(shù)據(jù)庫。同時(shí)我也參與到其他研究生的課題,構(gòu)造病毒質(zhì)粒以達(dá)到在細(xì)胞中過度表達(dá)目的基因的功能,具體地我做的是Dll1和NICD基因的插入,然后就可以通過提取RNA做RTqPCR和提取蛋白質(zhì)做western blot研究基因過度表達(dá)對Notch通道中幾個(gè)重要蛋白的表達(dá)水平的影響。
在這兩個(gè)月里,常強(qiáng)老師和實(shí)驗(yàn)室的師兄師姐都給了我很大的幫助,讓我學(xué)到了很多,既鍛煉了動(dòng)手做實(shí)驗(yàn)的技能,也訓(xùn)練了思維,我想后者是更為重要的。我和幾個(gè)研究生合作去完成一個(gè)項(xiàng)目,首先就要思考我們要做什么、為什么要這么做,其次才是如何去做,所以我們必須經(jīng)過反復(fù)思考、進(jìn)行可行性分析才能提出proposal。在項(xiàng)目期間,我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果并不如預(yù)期,統(tǒng)計(jì)分析得到的數(shù)據(jù)顯示的結(jié)果與假設(shè)完全不同,這就要求我們考量實(shí)驗(yàn)每一個(gè)環(huán)節(jié),在確認(rèn)結(jié)果無誤的情況下提出新的猜想。我和其他研究生一同構(gòu)建的質(zhì)粒也總是出現(xiàn)問題,我們就采用不同的方法嘗試連接載體和目的基因以達(dá)到最好的表達(dá)率,終于我們發(fā)現(xiàn)先把目的基因切成兩段再分步連接載體的方法是可行的。
最后我在實(shí)驗(yàn)室組會(huì)上做presentation以總結(jié)我兩個(gè)月來的工作,這是之前實(shí)驗(yàn)室里的本科生從來沒有的機(jī)會(huì)。我把這兩個(gè)月所作所學(xué)的總結(jié)為ppt演講,在講述過程中得到導(dǎo)師和研究生的指正和建議,讓我認(rèn)識(shí)到之前實(shí)驗(yàn)中存在的不足以及今后應(yīng)該前進(jìn)的方向。兩個(gè)月的暑期實(shí)習(xí)雖短,對我來說卻是受用匪淺,讓我在各方面都得到了提升。
李凱舟,女,2010級(jí)生命科學(xué)方向,曾獲得校級(jí)優(yōu)秀獎(jiǎng)學(xué)金B(yǎng)等兩次和凱原獎(jiǎng)學(xué)金一次。2012年前往美國威斯康辛大學(xué)麥迪遜分校常強(qiáng)實(shí)驗(yàn)室科研實(shí)習(xí)。
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