重組酶聚合酶擴(kuò)增技術(shù)檢測(cè)步驟
聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR),又稱無細(xì)胞克隆技術(shù)(“free bacteria” cloning technique),是一種在體外擴(kuò)增DNA片段的重要技術(shù)。當(dāng)存在模板DNA、底物、上下游引物和耐熱的DNA聚合酶時(shí),經(jīng)過多次“變性-復(fù)性-延伸反應(yīng)”的循環(huán)過程,痕量模板DNA可擴(kuò)增至幾百萬倍。
1.DNA半保留復(fù)制 是生物進(jìn)化和傳代的重要途徑。在生物體內(nèi),雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在DNA聚合酶與啟動(dòng)子的參與下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則復(fù)制成同樣的兩分子挎貝。在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),DNA在高溫時(shí)也可以發(fā)生變性解鏈,當(dāng)溫度降低后又可以復(fù)性成為雙鏈。因此,在生物體外,通過溫度變化控制DNA的變性和復(fù)性,并設(shè)計(jì)引物做啟動(dòng)子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以實(shí)現(xiàn)特定基因的體外復(fù)制。PCR通過變性、退火、延伸三個(gè)基本步驟完成一個(gè)循環(huán)。多次循環(huán)后,目的DNA可得以迅速擴(kuò)增。理論擴(kuò)增率為2n遞增(n為循環(huán)次數(shù)),25~30循環(huán),目標(biāo)DNA可增加109倍。由于引物和底物的消耗,酶活力的下降等因素,擴(kuò)增產(chǎn)物的增加,逐漸由指數(shù)形式變?yōu)榫€性形式,所以并不是循環(huán)次數(shù)越多越好。實(shí)際進(jìn)行30個(gè)循環(huán)后,擴(kuò)增倍數(shù)一般可達(dá)106~107。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4min,2~3h就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬倍。
2.標(biāo)準(zhǔn)PCR過程 分為三步,每一步的轉(zhuǎn)換通過溫度的改變控制。
(1)DNA模板解鏈(變性)(90~96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA。
(2)引物與模板結(jié)合(退火)(25~65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。
(3)DNA聚合酶催化新生DNA的合成(延伸)(70~75℃):在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為原料,從引物的5′端→3′端延伸,合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。此循環(huán)反復(fù)進(jìn)行,可使目的DNA得以迅速擴(kuò)增。
3.PCR反應(yīng)特點(diǎn) 特異性強(qiáng)、靈敏度高、簡(jiǎn)便快速和對(duì)標(biāo)本的純度要求低,不需要分離病毒或細(xì)菌及培養(yǎng)細(xì)胞,DNA粗制品及總RNA均可作為擴(kuò)增模板??芍苯佑门R床標(biāo)本如血液、體腔液、洗漱液、毛發(fā)、細(xì)胞、活組織等粗制的DNA擴(kuò)增檢測(cè)。
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