以家庭聯(lián)產(chǎn)承包為主、統(tǒng)分結合的雙層經(jīng)營體制逐漸建立，為農(nóng)業(yè)經(jīng)濟發(fā)展注入了新活力，也對農(nóng)業(yè)社會化服務提出了新要求。1990年中共中央、國務院在《關于一九九一年農(nóng)業(yè)和農(nóng)村工作的通知》中首次提出“農(nóng)業(yè)社會化服務體系”的概念，并且將服務主體確定為“合作經(jīng)濟組織、國家經(jīng)濟技術部門和其他各種服務性經(jīng)濟實體”。1991年，國務院就農(nóng)業(yè)社會化服務體系建設發(fā)出專項通知，指出“加強農(nóng)業(yè)社會化服務體系建設，是深化農(nóng)村改革，推動農(nóng)村有計劃商品經(jīng)濟發(fā)展的一項偉大事業(yè)”，還對“農(nóng)業(yè)社會化服務”的基本形式進行了科學界定，進一步明確了發(fā)展方向和原則，確立了農(nóng)業(yè)社會化服務體系的基本框架。1992～1998年，我國主要通過制定一系列政策法規(guī)，加快農(nóng)業(yè)技術推廣體系建設。例如，1993年《農(nóng)業(yè)技術推廣法》的頒布，以法律的形式明確了農(nóng)業(yè)技術推廣機構的地位和作用，為公益性推廣體系建設開辟了道路。1999年，首次對農(nóng)業(yè)技術推廣體系和農(nóng)業(yè)社會化服務體系之間的關系進行了界定，提出“農(nóng)業(yè)技術推廣體系是農(nóng)業(yè)社會化服務體系和國家對農(nóng)業(yè)支持保護體系的重要組成部分，是實施科教興農(nóng)戰(zhàn)略的重要載體”。2003年頒布的《中共中央關于完善社會主義市場經(jīng)濟體制若干問題的決定》指出，“深化農(nóng)業(yè)科技推廣體制和供銷社改革，形成社會力量廣泛參與的農(nóng)業(yè)社會化服務體系”，再次將農(nóng)業(yè)社會化服務體系建設確定為深化農(nóng)村改革，完善農(nóng)村經(jīng)濟體制的主要內(nèi)容之一。2004～2007年，4個中央一號文件多次對深化農(nóng)業(yè)科技推廣體系改革和建設作出明確部署，提出通過公益性服務與經(jīng)營性服務相結合的方法，完善農(nóng)技推廣的社會化服務機制。

這一階段隨著農(nóng)民收入從快速增長到增速放緩，中央將農(nóng)民增收問題擺在了突出重要位置。因此，我國逐步重視科技創(chuàng)新與技術進步在提高農(nóng)業(yè)綜合生產(chǎn)能力上的重要支撐作用，開始加大農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新與技術推廣體系建設。黨的十六大和十六屆三中全會把“三農(nóng)”問題提高到了空前的戰(zhàn)略位置。2007年中央一號文件又將“發(fā)展現(xiàn)代農(nóng)業(yè)”作為社會主義新農(nóng)村建設的首要任務，提出了現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的發(fā)展戰(zhàn)略，為社會化服務體系建設指明了方向。這一時期農(nóng)業(yè)社會化服務的概念內(nèi)涵得到科學界定，服務內(nèi)容涵蓋農(nóng)業(yè)產(chǎn)前產(chǎn)中產(chǎn)后環(huán)節(jié)，對農(nóng)業(yè)氣象服務、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全監(jiān)管和市場服務等服務領域也作出了新的要求，尤其是農(nóng)業(yè)科技推廣體制改革取得了重大進展。