酶的分子結(jié)構(gòu)與功能
第一節(jié) 酶的分子結(jié)構(gòu)與功能
一、酶的化學(xué)組成
根據(jù)酶的化學(xué)組成不同可將酶分為單純酶和結(jié)合酶。
(一)單純酶
單純酶是僅由氨基酸殘基構(gòu)成的單純蛋白質(zhì),通常只有一條多肽鏈。其催化活性主要由蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)所決定,如蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶、核糖核酸酶及淚液中的溶菌酶等。
(二)結(jié)合酶
結(jié)合酶由蛋白質(zhì)和非蛋白質(zhì)兩部分組成。蛋白質(zhì)部分稱為酶蛋白,非蛋白質(zhì)部分稱為輔助因子,酶蛋白與輔助因子結(jié)合形成的復(fù)合物稱為全酶。生物體內(nèi)多數(shù)酶屬于結(jié)合酶。
結(jié)合酶(全酶)=酶蛋白+輔助因子
輔助因子包括金屬離子、B族維生素的衍生物等。根據(jù)輔助因子與酶蛋白結(jié)合的牢固程度,可把輔助因子分為輔酶和輔基。與酶蛋白結(jié)合牢固,不能用透析等方法使之與酶蛋白分開(kāi)的稱為輔基;與酶蛋白結(jié)合疏松,能用透析法使兩者分離的稱為輔酶。
酶的催化作用有賴于全酶的完整性,酶蛋白或輔助因子單獨(dú)存在時(shí)均無(wú)催化活性,只有兩者結(jié)合組成全酶時(shí)才有催化活性。一種酶蛋白只能與一種輔助因子結(jié)合成一種有催化能力的全酶,而一種輔助因子可以與多種酶蛋白結(jié)合成有不同催化功能的全酶。在酶促反應(yīng)過(guò)程中,酶蛋白決定酶的專一性,而輔助因子決定反應(yīng)的類型。
二、酶的命名與分類
(一)酶的命名
1.習(xí)慣命名法
①以酶催化的底物加反應(yīng)的類型來(lái)命名,如乳酸脫氫酸、磷酸己糖異構(gòu)酶等;②水解酶類,習(xí)慣上只用底物名稱即可,如淀粉酶、蛋白酶等;③有時(shí)在底物前加上酶的來(lái)源,如胰淀粉酶、胃蛋白酶等。習(xí)慣命名法簡(jiǎn)單,使用方便,但有時(shí)會(huì)出現(xiàn)一酶數(shù)名或一名數(shù)酶的弊病。
2.系統(tǒng)命名法
1961年國(guó)際酶學(xué)委員會(huì)提出了一套系統(tǒng)命名法,使一種酶只有一個(gè)名稱。在這個(gè)系統(tǒng)內(nèi),一種酶是從其底物及所催化反應(yīng)的類型而得名,底物名稱之間以“:”分隔。同時(shí)每一種酶有四個(gè)數(shù)字組成的系統(tǒng)編號(hào),依次表示該酶所屬的類別、亞類、次亞類及編號(hào)。一般系統(tǒng)命名都較長(zhǎng),使用不方便。國(guó)際酶學(xué)委員會(huì)規(guī)定在發(fā)表以酶為主題的論文時(shí),在正文中第一次出現(xiàn)的酶要標(biāo)明酶的分類編號(hào)。
(二)酶的分類
國(guó)際酶學(xué)委員會(huì)按酶促反應(yīng)的性質(zhì)將酶分為六大類。
1.氧化還原酶類(oxidoreductases)
催化底物進(jìn)行氧化還原反應(yīng),如琥珀酸脫氫酶、細(xì)胞色素氧化酶、過(guò)氧化氫酶等。
2.轉(zhuǎn)移酶類(transferases)
催化底物之間某些基團(tuán)的轉(zhuǎn)移或交換,如轉(zhuǎn)氨酶、轉(zhuǎn)甲基酶、磷酸化酶等。
3.水解酶類(hydrolases)
催化底物發(fā)生水解反應(yīng),如胃蛋白酶、唾液淀粉酶、胰脂酶等。
4.裂解酶類(lyases)
該類酶也稱為裂合酶類,催化一種底物分解為兩種化合物或?qū)煞N化合物合成一種化合物的反應(yīng),如檸檬酸合成酶、醛縮酶、碳酸酐酶等。
5.異構(gòu)酶類(isomerases)
催化同分異構(gòu)體之間的相互轉(zhuǎn)化,如磷酸己糖異構(gòu)酶、磷酸丙糖異構(gòu)酶等。
6.合成酶類(synthetases)
催化兩分子底物化合為一分子化合物,且必須與ATP的磷酸鍵斷裂相偶聯(lián),如氨基酰-tRNA合成酶、谷氨酰胺合成酶等。
三、酶的活性中心
酶蛋白分子的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是具有活性中心。酶蛋白分子中存在有許多化學(xué)基團(tuán),如—NH2、—COOH、—SH、—OH等,這些基團(tuán)并不是都與酶的催化活性有關(guān)。其中,與酶活性密切相關(guān)的基團(tuán)稱為必需基團(tuán)(essential group)。常見(jiàn)的必需基團(tuán)有組氨酸殘基上的咪唑基、絲氨酸和蘇氨酸殘基上的羥基、某些酸性氨基酸殘基上的自由羧基和堿性氨基酸殘基上的氨基等。
酶分子中的必需基團(tuán)在一級(jí)結(jié)構(gòu)上可能相距很遠(yuǎn),但在空間結(jié)構(gòu)上彼此靠近,形成一個(gè)能與底物特異結(jié)合并催化底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的特定空間構(gòu)象的區(qū)域,這一區(qū)域稱為酶的活性中心(active center)或活性部位(active site)。對(duì)于結(jié)合酶來(lái)說(shuō),輔酶和輔基可參與酶的活性中心的組成。
構(gòu)成酶的活性中心的必需基團(tuán)分為兩種:一種是結(jié)合基團(tuán)(binding group),能與底物相結(jié)合,形成底物與酶的復(fù)合物;另一種是催化基團(tuán)(catalytic group),催化底物發(fā)生化學(xué)變化,并將其轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物。酶的活性中心內(nèi)有的必需基團(tuán)可同時(shí)具有這兩方面的功能,還有一些必需基團(tuán),雖然不參加活性中心的組成,但卻是維持酶的活性中心空間構(gòu)象所必需的,這些基團(tuán)稱為酶的活性中心以外的必需基團(tuán)(圖4-1)。
圖4-1 酶的活性中心示意圖
酶的活性中心是酶催化作用的關(guān)鍵部位。其活性中心一旦被其他物質(zhì)占據(jù)或某些理化因素使酶的空間構(gòu)象破壞,酶的活性就會(huì)喪失。
四、酶原與酶原的激活
有些酶在細(xì)胞內(nèi)合成和初分泌時(shí)并無(wú)催化活性,這種無(wú)活性的酶的前體稱為酶原。在一定的條件下,無(wú)活性的酶原轉(zhuǎn)變?yōu)橛谢钚悦傅倪^(guò)程稱為酶原激活。其實(shí)質(zhì)是酶的活性中心形成或暴露的過(guò)程。人體內(nèi)一些與消化作用、凝血作用、補(bǔ)體作用有關(guān)的酶在分泌時(shí)是以酶原形式存在的。
例如,胰蛋白酶原由胰腺分泌進(jìn)入小腸后,受腸激酶的激活,使第6位賴氨酸殘基與第7位異亮氨酸殘基之間的肽鍵斷裂,水解下一個(gè)6肽,酶分子的構(gòu)象發(fā)生改變,形成酶的活性中心,從而成為有催化活性的胰蛋白酶(圖4-2)。
圖4-2 胰蛋白酶原的激活示意圖
胰蛋白酶的形成,不僅能水解食物中的蛋白質(zhì),還能催化胰蛋白酶原的自身激活和小腸中其他蛋白酶原的激活,從而形成一個(gè)逐級(jí)加快的連鎖反應(yīng)過(guò)程。
酶原激活具有重要的生理意義。蛋白酶以酶原形式分泌,能保護(hù)組織器官本身不受酶的水解破壞,防止組織自溶,又可使酶到達(dá)特定部位發(fā)揮作用,從而保證體內(nèi)代謝過(guò)程正常進(jìn)行。如果胰蛋白酶原過(guò)早地在胰腺被激活,將使胰腺本身組織蛋白及血管遭到破壞,嚴(yán)重者將引起致命的出血性胰腺炎。又如在正常情況下血液中雖有凝血酶原,卻不會(huì)被激活,無(wú)血液凝固發(fā)生,一旦血管破損,凝血酶原被激活成凝血酶,催化纖維蛋白酶原變成纖維蛋白,使血液凝固,阻止大量失血,起到保護(hù)機(jī)體的作用。
知識(shí)鏈接
酶原激活與急性胰腺炎
正常胰腺可分泌以胰淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶等為主的消化酶,這些酶在正常情況下大多數(shù)以酶原的形式存在于胰腺細(xì)胞內(nèi),同時(shí)胰腺還能產(chǎn)生胰蛋白酶抑制物,以抑制胰蛋白酶的活性。當(dāng)胰腺在各種致病因子作用下使本應(yīng)在腸道中被激活的胰蛋白酶原與糜蛋白酶原在胰腺內(nèi)激活,這樣不僅使胰腺組織細(xì)胞受到破壞,產(chǎn)生胰腺壞死,而且被激活的酶還可進(jìn)入血液,造成嚴(yán)重后果。
五、同工酶
同工酶是指雖催化相同的化學(xué)反應(yīng),但酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)及免疫特性等卻不同的一組酶。這類酶存在于同一機(jī)體的不同組織中,甚至存在于同一組織細(xì)胞內(nèi)的不同亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中,它在代謝調(diào)節(jié)上起著重要的作用。
現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)百余種同工酶,如乳酸脫氫酶、核糖核酸酶、肌酸磷酸激酶、膽堿酯酶等。
乳酸脫氫酶(LDH)有心肌型(H)和骨骼肌型(M)兩種亞基,這兩種亞基以四聚體形式隨機(jī)組合成五種同工酶(圖4-3):LDH1(H4)、LDH2(H3M1)、LDH3(H2M2)、LDH4(H1M3)、LDH5(M4)。這五種同工酶具有不同的電泳速度。
圖4-3 乳酸脫氫酶同工酶的組成
LDH同工酶在各器官中的分布和含量不同,各器官組織都有其各自特定的分布酶譜及功能。如心肌中以LDH1含量最高,骨骼肌和肝中以LDH5含量最高。當(dāng)出現(xiàn)急性心肌梗死時(shí),心肌細(xì)胞缺血壞死,細(xì)胞內(nèi)的乳酸脫氫酶釋放入血,從血清同工酶電泳圖譜中可發(fā)現(xiàn)LDH1比例增加,故測(cè)定同工酶有助于疾病的診斷,同時(shí)也是現(xiàn)代醫(yī)學(xué)中診斷靈敏且可靠的手段之一。
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