在人身體的體表及其與外界相通的腔道，如口腔、鼻腔、咽喉、眼結(jié)合膜、腸道及泌尿生殖道等部位寄居著大量的細(xì)菌（及其他微生物），其中除極少數(shù)是有害的之外，絕大多數(shù)對(duì)人體是無害的，甚至是有益的。因?yàn)橛泻海O少）通常受到無害菌群（極多）的制約，所以從這個(gè)意義上說所有無害的菌群都是有益的，被稱為“有益菌群”。一般情況下，有益菌群總是占主導(dǎo)地位的。

人體細(xì)菌最為集中的部位是腸道，腸道細(xì)菌的規(guī)模蔚為壯觀，腸道堪稱是巨大的“細(xì)菌庫”，一個(gè)人腸道內(nèi)細(xì)菌總重量約為1 000克，相當(dāng)于肝臟的重量。其數(shù)量為1014個(gè)（百萬億），每一個(gè)細(xì)菌都是單細(xì)胞生物，故其細(xì)胞總數(shù)是人體自身細(xì)胞數(shù)量的10倍（人體自身的細(xì)胞只有1013個(gè)），是地球人口總數(shù)的2萬倍！在如此規(guī)模龐大的細(xì)菌族群中，絕大多數(shù)是有益菌群，并制約著極少數(shù)有害菌群，構(gòu)成腸道微生態(tài)。像自然界的生態(tài)需要平衡一樣，腸道微生態(tài)也需要平衡，如果有益菌群被削弱，平衡被破壞，則出現(xiàn)菌群失調(diào)，將會(huì)引起許多相關(guān)疾病。

腸道菌群有400～500種細(xì)菌，其形態(tài)各異，作用不一，特點(diǎn)各不相同，這給它們準(zhǔn)確命名帶來較大麻煩，很多時(shí)候，不得不根據(jù)它們的形態(tài)或某種功能來給它們命名，如桿菌（外形像“桿”一樣）、梭菌（外形似“梭”狀）、弧菌（外形似圓弧狀）、球菌（外形為球狀）、葡萄球菌（聚集成“葡萄串”一樣）等。當(dāng)然，實(shí)際上的腸道細(xì)菌命名很復(fù)雜，還要分“屬”“種”“株”等不同層次的類別。這些不但數(shù)量龐大，而且形態(tài)各異的細(xì)菌，除很少部分寄居于胃和小腸外，大部分都寄居在結(jié)腸（大腸），故又稱為“大腸菌群”（本書主要探討該部分菌群）。這些細(xì)菌按其對(duì)人體的作用是好是壞分成3大類。

1. 有益菌群　如類桿菌、雙歧桿菌、乳桿菌、優(yōu)桿菌、消化球菌等，這些細(xì)菌的共同特點(diǎn)是，在缺乏氧氣的環(huán)境下生長得更好（術(shù)語為“專性厭氧菌”）。它們的數(shù)量最大，占腸道菌群的99%～99.9%（其中僅類桿菌及雙歧桿菌就占細(xì)菌總數(shù)90%以上），具有絕對(duì)的優(yōu)勢(shì)。

2. 有害菌群　主要指致病菌，如耶爾森菌、沙門菌、志賀桿菌、變形桿菌、假單胞菌、韋榮菌、葡萄球菌、假絲酵母菌等，多為腸道的“過客”。在腸道微生態(tài)平衡時(shí)，它們的數(shù)量很少，不會(huì)致病，如果因?yàn)槟撤N原因，其數(shù)量超出了正常水平，則會(huì)引發(fā)疾病。

3. 雙向性菌群　如腸球菌、大腸埃希菌等，在腸道內(nèi)長期存在，但數(shù)量不多，一般情況下是無害的，但在某些情況下，如細(xì)菌移位、菌群失調(diào)等，則具有侵襲性，對(duì)人體有害，甚至?xí)谂R床實(shí)踐中造成難以控制的感染。

正常菌群（有益菌群）對(duì)人體不但是有益的，而且是必須的。沒有正常菌群，生命很難存活。腸道菌群不但總重量與肝臟相當(dāng)，其作用也絲毫不遜色于肝臟。它們參與機(jī)體代謝的全過程，參與腸道毒物的分解、消化過程，與人體健康狀態(tài)休戚相關(guān)。目前認(rèn)為，腸道菌群是正常生理的必要組成部分。實(shí)際上，隨著對(duì)腸道菌群的研究，腸道微生態(tài)理論的建立與成熟，人們對(duì)結(jié)腸的認(rèn)識(shí)也發(fā)生了很大的改變，它不再是過去所認(rèn)為的“藏污納垢”之處或儲(chǔ)存糞便的“下水道”，而成為有益菌群滋生繁衍的、充滿生機(jī)和活力的綠洲。龐大的有益菌群利用人體經(jīng)小腸消化的食物殘?jiān)M(jìn)行復(fù)雜的發(fā)酵工程，并在人體的代謝、營養(yǎng)、免疫功能發(fā)育與成熟，以及延緩衰老、抗癌、抗感染等諸多方面發(fā)揮著重要作用。