1．單張光學(xué)切片　光學(xué)切片是共聚焦顯微鏡的基本圖像單位。標(biāo)本經(jīng)固定后，采用不同熒光探針進(jìn)行標(biāo)記，選擇適當(dāng)?shù)募ぐl(fā)光進(jìn)行觀察，以數(shù)字圖像的形式進(jìn)行儲(chǔ)存。采集單幅光學(xué)切片約需1s。

2．延時(shí)成像和活細(xì)胞成像　延時(shí)成像和活細(xì)胞成像是LSCM的特有功能。借助CCD系統(tǒng)，使用預(yù)先設(shè)定的時(shí)間間隔，采集一幅光學(xué)切片圖像，從而可以動(dòng)態(tài)觀察檢測(cè)對(duì)象的變化。對(duì)于活細(xì)胞成像，細(xì)胞需放置在LSCM配備的小型CO2培養(yǎng)箱內(nèi)，在操作時(shí)應(yīng)注意使用最小強(qiáng)度的激光，盡量避免激光束造成的光損傷，必要時(shí)可在培養(yǎng)液中適當(dāng)添加一些抗氧化劑（如維生素C），而對(duì)于一些熒光標(biāo)記實(shí)驗(yàn)，需評(píng)價(jià)光暴露對(duì)標(biāo)本的影響，成像后應(yīng)進(jìn)一步評(píng)估細(xì)胞活性。

3．Z掃描和三維重建　Z掃描是在標(biāo)本的不同平面采集一系列圖像。Z掃描是通過計(jì)算機(jī)控制的步進(jìn)馬達(dá)以預(yù)先設(shè)定的步距移動(dòng)顯微鏡的鏡臺(tái)完成的，移動(dòng)1個(gè)步距，采集一幅圖像并進(jìn)行儲(chǔ)存，直到所有需要采集的圖像都采集完成。常從Z掃描圖像系列中選擇2～3幅圖像進(jìn)行數(shù)字化疊加顯示特異結(jié)構(gòu)。Z掃描圖像可進(jìn)一步處理成3D圖像，這是研究3D結(jié)構(gòu)和組織功能之間關(guān)系的方法之一。需要注意的是為了反映標(biāo)本的實(shí)際厚度，在進(jìn)行Z掃描時(shí)應(yīng)選擇正確的步距采集圖像。

4．四維圖像　當(dāng)進(jìn)行活細(xì)胞成像時(shí)，用LSCM采集的Z掃描延時(shí)圖像，可產(chǎn)生4D圖像［3個(gè)空間量綱（X、Y、Z）和1個(gè)時(shí)間量綱］，借助4D觀看程序，以電影形式放映。