腺病毒呈無囊膜的球形結(jié)構(gòu)，其病毒粒子在感染的細(xì)胞核內(nèi)常呈晶格狀排列，每個病毒顆粒包含一個36kb的線性雙鏈DNA，兩端各有一個100～600bp的反向末端重復(fù)序列（inverted terminal repeat，ITR），ITR的內(nèi)側(cè)為病毒包裝信號，是病毒包裝所需要的順式作用元件。基因組包含早期表達的與腺病毒復(fù)制相關(guān)的E1－E4基因和晚期表達的與腺病毒顆粒組裝相關(guān)的L1－L5基因。線狀雙股DNA與核心蛋白形成直徑為60～65nm的髓芯，被包裹于衣殼內(nèi)。衣殼呈二十面體對稱，由252個直徑8～10nm的殼粒組成，殼粒排列在三角形的面上，每邊6個，其中240個為六鄰體（非頂點殼粒），另12個為五鄰體基底（頂點殼粒）。每個六鄰體是六鄰體蛋白的同源三聚體，三聚體的六鄰體分子有一個三角形的塔尖和五面體的基底，塔區(qū)由4個環(huán)構(gòu)成，即loop1、loop2、loop3、loop4，基底包含兩個區(qū)域P1、P2區(qū)。六鄰體上的表位（epitope）是診斷不同血清型的標(biāo)準(zhǔn)，它包括哺乳動物腺病毒屬的抗原成分，是病毒體對免疫選擇壓力最敏感的部位。每個五鄰體基底上結(jié)合著1根（哺乳動物腺病毒）或2根（禽腺病毒）長9～77．5nm的纖維突起，這些纖維以五鄰體蛋白為基底由衣殼面伸出，纖維頂端形成頭節(jié)區(qū)，纖突有血清特異性，且含有負(fù)責(zé)體外血細(xì)胞凝集的種屬特異性抗原決定位點。