要想成為一個合法的市場經(jīng)濟主體，必須進行設立登記，農(nóng)民專業(yè)合作社在設立登記的過程中，一般要經(jīng)過以下幾個主要程序。

（一）召開設立大會

在農(nóng)民專業(yè)合作社進行注冊登記之前，首先要召開設立大會。設立大會由全體愿意加入農(nóng)民專業(yè)合作社的成員參加。在召開設立大會的過程中，需要完成以下事項：

（1）通過全體設立人一致同意的章程。章程是規(guī)定農(nóng)民專業(yè)合作社相關主體共同遵守的規(guī)定或協(xié)議。因為農(nóng)民專業(yè)合作社絕大多數(shù)成員是農(nóng)民，如何起草章程就成為擺在農(nóng)民專業(yè)合作社成員面前的一道難題，為了解決這一問題，也為了使章程做到規(guī)范，農(nóng)業(yè)部專門出臺了《農(nóng)民專業(yè)合作社示范章程》，這給各個農(nóng)民專業(yè)合作社提供了一個樣本或范本，減少了起草成本和難度。因此，從總體上來說，各個農(nóng)民專業(yè)合作社的章程基本內(nèi)容都是一致的，只不過在有些條款中不同合作社各有側(cè)重。召開設立大會，全體設立人要對章程進行認真審議，最后由所有設立人在起草好的章程后面簽字、蓋章，表明所有設立人將在農(nóng)民專業(yè)合作社運行過程中承認章程規(guī)定的所有條款，履行賦予的義務。

（2）選舉產(chǎn)生理事長、理事、執(zhí)行監(jiān)事或者監(jiān)事會成員。設立大會召開的過程，也是選舉產(chǎn)生農(nóng)民專業(yè)合作社主要管理成員的過程。首先要由全體設立人選舉產(chǎn)生理事長，因為理事長是合作社的法定代表人，后期的一系列活動都要由理事長來主持。此外，如果農(nóng)民專業(yè)合作社中設立理事會、執(zhí)行監(jiān)事或者監(jiān)事會，那么在召開設立大會的時候也要一并由全體設立人選舉產(chǎn)生。

（3）形成設立大會紀要。整個設立大會是如何進行的，經(jīng)過了哪幾個程序，形成了哪些決定，對于這些事項都要做完整的記錄，這個記錄就是設立大會紀要。設立大會紀要要保存完好，因為在到登記機關進行注冊登記的時候，需要提交該紀要。一般情況下，設立大會紀要要有兩份，一份原件和一份復印件，其中一份自己保存留作檔案，另一份交登記機關。

（二）進行設立登記

按照《農(nóng)民專業(yè)合作社法》及《農(nóng)民專業(yè)合作社登記管理條例》的規(guī)定，工商行政管理部門（工商局）是農(nóng)民專業(yè)合作社登記機關。國務院工商行政管理部門負責全國的農(nóng)民專業(yè)合作社登記管理工作。縣（旗）、縣級市工商行政管理局和地區(qū)（州、盟）、地級市工商行政管理局的分局，以及直轄市的工商行政管理分局負責本轄區(qū)內(nèi)農(nóng)民專業(yè)合作社的登記。

1.登記項目　農(nóng)民專業(yè)合作社需要登記的事項包括以下幾項：

（1）名稱。工商登記機關主要審核名稱是否合適、是否和本轄區(qū)內(nèi)已登記的同類合作社的名稱相同、是否需要預先核準等。凡是涉及“種子生產(chǎn)經(jīng)營”“種畜禽生產(chǎn)經(jīng)營”“化肥、農(nóng)藥等生產(chǎn)資料的生產(chǎn)經(jīng)營”等需要進行登記前置許可的農(nóng)民專業(yè)合作社，都需要進行名稱預先核準。

（2）住所。工商登記機關主要審核住所是否具備，是否有住所使用證明。農(nóng)民專業(yè)合作社應當標明住所所在縣（市、區(qū)）、鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）及村、街道的門牌號碼。

（3）出資額。登記機關審核農(nóng)民專業(yè)合作社的出資清單，并以出資清單上載明的出資總額作為農(nóng)民專業(yè)合作社的出資額。

（4）業(yè)務范圍。工商登記機關主要審核農(nóng)民專業(yè)合作社章程中規(guī)定的業(yè)務范圍是否適宜其真實的業(yè)務實際，是否有需要進行前置許可的義務范圍，如“種子生產(chǎn)經(jīng)營”等。

（5）法定代表人姓名。也就是理事長的姓名。工商登記機關要審核該法定代表人是否有任職資格，是否還擔任其他同類農(nóng)民專業(yè)合作社的理事長或管理職務，因為在法律中規(guī)定，農(nóng)民專業(yè)合作社的理事長不得擔任同類性質(zhì)農(nóng)民專業(yè)合作社的理事長、理事、監(jiān)事等。

2.登記需提交的文件　普通情況下，農(nóng)民專業(yè)合作社登記時需要提交的文件有八項：

（1）登記申請書。在申請的過程中需要填寫設立登記申請書（見表1-1）。

表1-1　農(nóng)民專業(yè)合作社設立登記申請書

（2）全體設立人簽名、蓋章的設立大會紀要。

（3）全體設立人簽名、蓋章的章程。

注：（2）和（3）中，如果設立人是自然人，則需要用鋼筆、毛筆或簽字筆在設立大會紀要、章程上簽名，自然人以外的設立人要加蓋公章。

（4）法定代表人、理事的任職文件及身份證明。例如，法定代表人要填寫下表，以證明其身份（見表1-2）。

表1-2　農(nóng)民專業(yè)合作社法定代表人登記表

（5）載明成員姓名或者名稱、出資方式、出資額以及成員出資總額，并經(jīng)出資成員簽名、蓋章予以確認的出資清單（見表1-3）。其中的出資方式可以是貨幣、實物或知識產(chǎn)權等。以貨幣作為出資的填寫“貨幣”，以實物、知識產(chǎn)權等可以用貨幣估價并可以依法轉(zhuǎn)讓的非貨幣財產(chǎn)作為出資的，填寫非貨幣財產(chǎn)的具體種類，如房屋、農(nóng)業(yè)機械、注冊商標等。對于出資額，如果成員以貨幣出資，則為出資的實際數(shù)額，如果成員以非貨幣財產(chǎn)出資，則是由全體成員評估作價的貨幣數(shù)額。

表1-3　農(nóng)民專業(yè)合作社成員出資清單

（6）載明成員姓名或名稱、公民身份證號碼或者登記證書號碼和住所的成員名冊，以及成員身份證明（見表1-4、表1-5）?！掇r(nóng)民專業(yè)合作社登記管理條例》第十五條規(guī)定，農(nóng)民專業(yè)合作社的成員為農(nóng)民的，成員身份證明為農(nóng)業(yè)人口戶口簿；無農(nóng)業(yè)人口戶口簿的，成員身份證明為居民身份證和土地承包經(jīng)營權證或者村民委員會（居民委員會）出具的身份證明。農(nóng)民專業(yè)合作社的成員不屬于農(nóng)民的，成員身份證明為居民身份證。農(nóng)民專業(yè)合作社的成員為企業(yè)、事業(yè)單位或者社會團體的，成員身份證明為企業(yè)法人營業(yè)執(zhí)照或者其他登記證書。

表1-4　農(nóng)民專業(yè)合作社成員名冊

表1-5　農(nóng)民專業(yè)合作社成員身份證明復印件

（7）住所使用證明。如果農(nóng)民專業(yè)合作社以成員自有場所作為住所的，應當提交該農(nóng)民專業(yè)合作社有權使用的證明及場所的產(chǎn)權證明；租用他人場所的，應當提交租賃協(xié)議及場所的產(chǎn)權證明；因場所在農(nóng)村沒有房管部門頒發(fā)的產(chǎn)權證明的，可提交場所所在地村民委員會出具的證明。

（8）全體設立人指定代表或者委托代理人的證明。辦理農(nóng)民專業(yè)合作社登記事項需要指定代表或委托代理人。為此，全體設立人要出具證明，并在證明上標注是否同意該代表或委托代理人修改有關表格的填寫錯誤，寫清指定或者委托的有效期限，在證明上粘貼該代表或委托代理人的身份證復印件。

（三）取得營業(yè)執(zhí)照

《農(nóng)民專業(yè)合作社登記管理條例》第十六條規(guī)定，“申請人提交的登記申請材料齊全、符合法定形式，登記機關能夠當場登記的，應予當場登記，發(fā)給營業(yè)執(zhí)照?！币簿褪钦f，只要農(nóng)民專業(yè)合作社提交的申請材料符合法律法規(guī)的要求，登記機關就應該無條件地給予登記并發(fā)給營業(yè)執(zhí)照，而且按照規(guī)定，農(nóng)民專業(yè)合作社登記不收取任何登記費。此外，如果農(nóng)民專業(yè)合作社申請過程中有些條件不符合，或有瑕疵，登記機關也應當就是否給予登記作出說明，按照要求，受理機關應當自受理申請之日起20日內(nèi)，作出是否登記的決定。予以登記的，發(fā)給營業(yè)執(zhí)照；不予登記的，應當給予書面答復，并說明理由。營業(yè)執(zhí)照簽發(fā)日期即為農(nóng)民專業(yè)合作社成立日期。營業(yè)執(zhí)照有正本和副本之分，并具有同等的法律效力。正本應置于住所的醒目位置。自取得營業(yè)執(zhí)照之日起，農(nóng)民專業(yè)合作社就成為合法的市場經(jīng)營主體，就可以從事合法的生產(chǎn)經(jīng)營活動了。獲取營業(yè)執(zhí)照之后，為了使生產(chǎn)經(jīng)營順利地進行，農(nóng)民專業(yè)合作社還需到稅務部門辦理稅務登記，取得稅務登記證明，以便稅務部門進行監(jiān)管。隨后，農(nóng)民專業(yè)合作社拿著營業(yè)執(zhí)照和稅務登記證明，到銀行開立農(nóng)民專業(yè)合作社專有的銀行賬戶，以便進行存貸款業(yè)務以及貨款的往來。