政府應(yīng)急預(yù)案要求組建強(qiáng)有力的應(yīng)急組織機(jī)構(gòu)，構(gòu)建完整的應(yīng)急組織體系。其中，正確地對上下級政府之間進(jìn)行緊急權(quán)力分工是基礎(chǔ)。上下級政府在應(yīng)急管理活動中，應(yīng)當(dāng)分工明確，職責(zé)清楚。唯有如此，才可以既保證中央政府的權(quán)威，又發(fā)揮地方政府的積極主動性，有效推動應(yīng)急預(yù)案的實(shí)施，成功預(yù)防和克服危機(jī)。在2003年SRAS疫情擴(kuò)散的過程中，根據(jù)《傳染病防治法》第三條的規(guī)定，國務(wù)院可以根據(jù)情況增減甲、乙、丙三級傳染病病種，而省級政府卻無權(quán)根據(jù)當(dāng)?shù)厍闆r來增加新的病種，以至于當(dāng)SRAS在廣東出現(xiàn)后，當(dāng)?shù)卣碗y以立即依法控制傳染病，從而失去了緩解疫情的最有利時機(jī)。從經(jīng)驗(yàn)上看，絕大部分突發(fā)事件都是起源于地方的，因此在中央和地方的分工上，世界各國立法的通行做法是采取地方負(fù)主要責(zé)任的原則。

我國的國家機(jī)構(gòu)從總體上來看屬于中央集權(quán)型的單一制。改革開放后，通過簡政放權(quán)，地方政府有了一定的主動權(quán)，但是由于地方權(quán)力仍受中央統(tǒng)轄，地方政府自主處理問題的余地仍然較小。對此，當(dāng)面對突發(fā)事件時，我們需要借鑒他國經(jīng)驗(yàn)，進(jìn)行改革，確立上下級政府之間一般以下級政府發(fā)揮主要作用、負(fù)主要責(zé)任的原則。在合理確定中央和地方政府職能的基礎(chǔ)上，盡可能多地給地方政府以更大的權(quán)力。具體而言，在突發(fā)事件中，一般要求突發(fā)事件發(fā)生地的當(dāng)?shù)卣拖嚓P(guān)部門負(fù)責(zé)全部的治理工作。中央對地方、上級對下級政府僅提供宏觀政策上的指導(dǎo)，然而，上級政策的實(shí)施是否到位、是否有效主要依靠地方政府來具體執(zhí)行。因此，上下級政府的應(yīng)急職責(zé)分工應(yīng)該是，中央政府集中資源搞好全民性公共物品的供給，建立獨(dú)立于地方的垂直供給體系，而非在全民性公共物品的供給方面則應(yīng)向地方政府放權(quán)，賦予地方更多的自主權(quán)。

另外，在突發(fā)事件的預(yù)防和應(yīng)對活動中，要使上下級政府充分發(fā)揮其職能，還需要做好它們之間的信息溝通工作，保障信息溝通渠道的暢通。對此，主要是完善信息的逐級上報制度。該制度的具體規(guī)定應(yīng)當(dāng)包括:必須上報的信息類型、上報的時限、上報的主體，以及不報、謊報、緩報等行為的法律責(zé)任。如此方能保證上級機(jī)關(guān)在盡可能短的時間內(nèi)得到信息、形成判斷、做出決策。另一方面，暢通的信息機(jī)制也能保證上級機(jī)關(guān)的決策及時下達(dá)，得到完整的貫徹執(zhí)行。