綜合多數(shù)生態(tài)管理學(xué)家的觀點(diǎn)，生態(tài)系統(tǒng)管理的基本內(nèi)容可以概括為以下幾個(gè)方面。

（1）管理的目標(biāo)要達(dá)到保護(hù)生態(tài)系統(tǒng)的健康和完整?？v觀前人對(duì)生態(tài)系統(tǒng)管理的認(rèn)識(shí)，多數(shù)都將生態(tài)系統(tǒng)與社會(huì)經(jīng)濟(jì)系統(tǒng)之間的協(xié)調(diào)發(fā)展作為生態(tài)系統(tǒng)管理的核心，而將對(duì)生態(tài)系統(tǒng)的組成、結(jié)構(gòu)和功能的最佳理解作為實(shí)現(xiàn)生態(tài)系統(tǒng)管理目標(biāo)的基礎(chǔ)。為此，人類的社會(huì)經(jīng)濟(jì)活動(dòng)應(yīng)考慮自然系統(tǒng)的平衡和需求。

（2）在生態(tài)管理過(guò)程中識(shí)別閾值是必需的。閾值是指當(dāng)生態(tài)系統(tǒng)退化到這個(gè)水平以下時(shí)，某些主要的性質(zhì)或功能就必然會(huì)喪失。在許多情況下，閾值代表了在生態(tài)系統(tǒng)功能與人類利用之間的一種權(quán)衡。盡管很難找到一條準(zhǔn)確的分界線，但可以找到一個(gè)表現(xiàn)隨著人類利用的提高開始逐漸危及生態(tài)系統(tǒng)功能的區(qū)間。生態(tài)系統(tǒng)科學(xué)家及生態(tài)系統(tǒng)管理者的一個(gè)重要職能就是開發(fā)利用識(shí)別閾值的工具，為生態(tài)系統(tǒng)確定出不同的閾值水平，并將所獲得的數(shù)據(jù)提供給決策者。^[37]

（3）生態(tài)系統(tǒng)管理的尺度必須有足夠的彈性和適應(yīng)性。適應(yīng)性管理是指在生態(tài)系統(tǒng)功能和社會(huì)需要兩方面建立可測(cè)定的目標(biāo)，通過(guò)控制性的科學(xué)管理、監(jiān)測(cè)和調(diào)整管理活動(dòng)來(lái)提高當(dāng)前的數(shù)據(jù)收集水平，以滿足生態(tài)系統(tǒng)容量和社會(huì)需求方面的變化。人類對(duì)生態(tài)系統(tǒng)的需求可能引起環(huán)境的變化，變化速率過(guò)快則會(huì)超出系統(tǒng)內(nèi)許多物種的承受力，所以，管理必須從有效性出發(fā)靈活地處理新的信息并做出相應(yīng)的調(diào)整。

（4）強(qiáng)調(diào)人類是生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分。生態(tài)系統(tǒng)管理是一種基于生態(tài)系統(tǒng)知識(shí)的管理和評(píng)價(jià)方法，這種方法將生態(tài)系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)、功能和過(guò)程以及人類、社會(huì)需求、經(jīng)濟(jì)需求融合在一起。從基本上說(shuō)，生態(tài)系統(tǒng)管理是人類對(duì)生態(tài)系統(tǒng)進(jìn)行的有效管理，從而保證生態(tài)系統(tǒng)的可持續(xù)性。整個(gè)管理過(guò)程不能割裂人與自然的聯(lián)系，要考慮人與自然的相互作用，并確立科學(xué)的價(jià)值觀，綜合評(píng)價(jià)生態(tài)系統(tǒng)的價(jià)值，以最終實(shí)現(xiàn)管理目標(biāo)。

生態(tài)系統(tǒng)管理的目的在于維持所有自然物種的生存，保護(hù)各種原生生態(tài)系統(tǒng)的完整性，維持正常的進(jìn)化和生態(tài)過(guò)程以及物種與生態(tài)系統(tǒng)的進(jìn)化潛力，并在維持生態(tài)系統(tǒng)健康的基礎(chǔ)上滿足人類開發(fā)與利用的需要?；谏鷳B(tài)系統(tǒng)的管理體現(xiàn)了管理的層次關(guān)系，所以，在實(shí)施管理時(shí)要有系統(tǒng)觀，綜合考慮所有基因、物種、種群和環(huán)境等層面上的內(nèi)在聯(lián)系；要在適當(dāng)?shù)某叨壬铣秸位蛐姓吔?，保護(hù)自然物種的變化，維持種群的自然擾動(dòng)，保持自然變化范圍內(nèi)的生態(tài)系統(tǒng)代表性等；要進(jìn)行深入的數(shù)據(jù)信息收集，包括生境類型與分布、自然擾動(dòng)變化和種群變化評(píng)估等；要按照適應(yīng)性管理的原則，借鑒以往的經(jīng)驗(yàn)，不斷改進(jìn)管理決策以適應(yīng)不確定性；要對(duì)現(xiàn)有的管理結(jié)構(gòu)與機(jī)制進(jìn)行調(diào)整，并采取多部門合作的方式解決出現(xiàn)的沖突。